Hi-C三维基因组学染色质结构基因表达调控三维基因组学在基因组序列,基因结构及其调控元件的基础上对细胞核内的染色质的三维空间结构进行研究.染色体的空间交互作用是基因表达调控的重要因素,随着高通量染色体构象捕获(high-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)技术及其衍生技术的出现和快速发展,借助Hi-C技术获...
什么是Hi-C，Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高...
Hi-C：技术源于基因组捕获技术 ( Chromosome conformation capture) ，以整个细胞核为研究对象，利用高...
Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture) Hi-C是一种用于研究染色体三维结构的技术,能够捕获基因组中不同区域的物理接触信息,帮助绘制染色体折叠结构和基因组架构。 1、Hi-Fi 测序与 Hi-C 技术对比及应用概览 详细解释: Hi-Fi 测序:提供高准确度的DNA序列数据,主要用于基因组组装、变异检测、转录组...
Hi-C技术。近年最火的全基因组 3D 基因组测序技术,不仅可以用于检测全基因组的三维基因组结构和染色质互作,同时还可以用于辅助基因组组装(同样用的很多,现在组参考基因组都要测HiC,以组装到染色体水平)等。 ChIA-PET技术( chromatin interaction analysis paired-end tag sequencing):与3C基础上发展的其他技术不同,...
3D-Genome | Hi-C互作矩阵归一化指南 Hi-C 是一种基于测序的方法,用于分析全基因组染色质互作。它已广泛应用于研究各种生物学问题,如基因调控、染色质结构、基因组组装等。Hi-C 实验涉及一系列生物化学反应,可能会在输出中引入噪声。随后的数据分析也会产生影响最终输出噪声:互作矩阵,其中矩阵中的每个元素表示基因...
Hi-C,三维基因组学研究利器,一, Hi-C发展历史 DNA在染色体上是高度折叠的,DNA与DNA片段之间不可避免的形成了高强度的交互作用, 对基因的表达、远端调控等起重要作用。2002年Dekker等[1]提出利用3C技术研究染色体的 三维构象,该技术基于PCR原理,针对特定位点设计上下游引物,用于研究单个点和点之间的 ...
图4ENCODE Hi-C数据展示 总结 N 基于基因组二维数据结构研究生命现象已经不能满足现在科研的需求,随着探索染色质三维结构技术的出现,能够帮助人类更深刻的理解细胞核中染色质的三维构象以及内容。 文章来源于:生信草堂 本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请...
最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序.docx,最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序 Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture,3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在
2018年9月10日,在发表于Nature Genetics的一项最新研究中,宾夕法尼亚州立大学岳峰课题组等团队,通过将Hi-C技术、WGS和Bionano光学图谱技术与一种基于Hi-C数据的新算法结合,开发了一种SV综合检测方法,可用于癌症基因组SV的系统分析,能够全面了解癌症基因组变化。该研究还发现了癌症中潜在的非编码SV,确定了此前癌症...