Hi-C三维基因组学染色质结构基因表达调控三维基因组学在基因组序列,基因结构及其调控元件的基础上对细胞核内的染色质的三维空间结构进行研究.染色体的空间交互作用是基因表达调控的重要因素,随着高通量染色体构象捕获(high-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)技术及其衍生技术的出现和快速发展,借助Hi-C技术获...
4.调控元件开发:Hi-C技术可以与RNA-Seq、ChIP-Seq等数据联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络角度阐述疾病发生的分子机制。三、Hi-C技术的特点 1.高通量和高分辨率:Hi-C技术能够提供全基因组范围内的互作信息,获得高分辨率的染色质三维结构信息,这对于医学科研中的基因组学研究尤为重要。2.全基因组覆盖:H...
2023年4月,德国马克斯·普朗克分子遗传学、发育和疾病组研究所Uirá Souto Melo团队在Nature Communications上发表研究成果。该研究显示,在一起罕见的异位骨化症病例中,多重技术检测到与病症有关的结构变异,其中Trio-WES未检测到任何致病的结构变异,array-CGH检测到其2号染色体上存在约820 kb的杂合重复。荧光原位杂交 (...
2023年4月,德国马克斯·普朗克分子遗传学、发育和疾病组研究所Uirá Souto Melo团队在Nature Communications上发表研究成果。该研究显示,在一起罕见的异位骨化症病例中,多重技术检测到与病症有关的结构变异,其中Trio-WES未检测到任何致病的结构变异,array-CGH检测到其2号染色体上存在约820 kb的杂合重复。荧光原位杂交 (...
Hi-C 研究重点是空间构象与基因转录调控间的关系。通过 Hi-C,可以深入研究基因组的折叠和空间构 象、...
最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序.docx,最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序 Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture,3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在
基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象。高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformation capture, Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识。研究表明,哺...
Hi-C三维基因组学研究利器(一).PDF,Hi-C :三维基因组学研究利器 (一) Hi-C 发展历史 DNA 在染色体上是高度折叠的,DNA 与 DNA 片段之间不可避免的形成了高强度的交互作用, 对基因的表达、远端调控等起重要作用。2002 年 Dekker 等[1]提出利用 3C 技术研究染色体的 三
capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法, 研究全基因组范围内...
Hi-C技术。近年最火的全基因组 3D 基因组测序技术,不仅可以用于检测全基因组的三维基因组结构和染色质互作,同时还可以用于辅助基因组组装(同样用的很多,现在组参考基因组都要测HiC,以组装到染色体水平)等。 ChIA-PET技术( chromatin interaction analysis paired-end tag sequencing):与3C基础上发展的其他技术不同,...