hi-c辅助组装即通过捕获染色体dna的交互关系,根据染色体内部互作频率显著高于染色体间互作频率,同时,在同一条染色体上互作频率随着互作距离的增加而减少的原理,将scaffold或者contig聚类到组群,并进一步对组群内的contig/scaffold进行排序及定向,实现趋近于染色体水平的基因组挂载。 3、近年来已发表的高质量动植物基因组,...
Hi-C互作三大规律 1.染色体内互作富集(Intrachromosomal interaction enrichment) 2.互作随距离衰减(distance-dependent interaction decay) 3.局部互作平滑(local interaction smoothness) 2.Hi-C技术辅助基因组组装目的 将contigs组装到假染色体层面,实现基因组组装到染色体层面 ...