单细胞转录组与蛋白质组的联合运用,能够有效整合多维度信息,进而提升对生物学过程的解析能力。一方面,通过关联二者的数据,可以更为准确地推断差异蛋白的细胞来源,为深入探究细胞间的调控网络提供关键线索;另一方面,这种联合方式有助于在众多潜在分子中筛选出具有生物标识功能的分子,通过相互印证和补充,进一步明确候选生物标志物的范
转录组和蛋白组联合分析在生物学和医学研究中具有重要的优势,主要体现在以下几个方面: 1.全面性 转录组分析关注基因表达水平,而蛋白组分析则关注蛋白质的表达水平。联合分析可以提供更全面的生物学信息,从基因到蛋白质的全景视图,帮助研究者更好地理解细胞功能和生物过程。 2.功能验证 转录组数据可以揭示哪些基因在特...
技术手段:转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组 研究内容:研究者对拟南芥的30种组织进行非标蛋白质组、磷酸化修饰组以及转录组的定量分析,结果提供了有多少基因以蛋白质的形式存在(超过18000个),它们在哪里表达,数量(超过6个数量级的动态范围)以及它们的磷酸化程度(超过43000个位点)。作者举例说明如何使用这些数据,例如...
综上所述,“转录组+蛋白组”联合分析表明YB-1在胶质母细胞瘤形成过程中可能参与的调控通路,为揭示YB-1/CCT4/mLST8/mTOR通路在促进胶质母细胞瘤生长中的作用提供了重要的研究方向。 进阶转录组+蛋白组联合分析案例 银耳(Tremella fuciformis)的主要活性成分岩藻多糖(TPS)已被报道具有抗氧化、抗炎、抗肿瘤、抗群体...
首先需要选择某个或某几个炎症通路相关的基因(前述转录组-蛋白质组联合分析中筛选而来)作为候选,进行功能验证。具体来说,就是同样进行体外实验,验证这些基因在高糖环境处理下,长3’UTR亚型显著增加,且促进其蛋白水平表达。 第二步需要将3’UTR长度与细胞表型相结合。具体来说,先要明确APA调控的是哪种细胞类型,是...
转录组和蛋白组联合分析是一种强大的生物学研究方法,通过整合来自转录组测序(RNA-Seq)和蛋白质组学(Proteomics)的数据,可以更全面地理解基因表达调控及其在生物体功能中的作用。这种方法不仅揭示了mRNA水平的变化,还深入探究了这些变化如何转化为蛋白质水平的差异,从而提供对生物过程更深入的洞察。 二、转录组测序(RNA...
综上所述,本案例主要是以“转录组+DIA蛋白组”作为组学研究策略,分析思路如下所示, 1、单组学分析:差异分析、富集分析; 2、关联分析:共富集通路分析、PPI网络分析→确定关键富集通路、筛选目的基因; 3、目的基因功能研究:目的基因序列组成分析、编码蛋白结构预测;目的基因对菌株生物功能的影响。
挖掘转录组和蛋白组数据中的稀有变异信息。转录组和蛋白组整合可用于植物抗逆机制的研究。采用多组学联合策略深化转录组和蛋白组整合分析。该分析能研究神经系统疾病中基因和蛋白的异常。利用差异共表达分析转录组和蛋白组的协同变化。转录组和蛋白组整合可探索微生物与宿主互作的分子基础。
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; ...
转录组-蛋白组强强联合: 两组学数据信息互补,对生物体特定状态下的生理机制进行全方位解析; 分析同一基因转录水平和翻译水平的变化,全面挖掘关键基因表达调控机制; 转录组可以为蛋白组提供更完整的数据库,提高蛋白鉴定数目和质量。 转录组-蛋白质组联合分析流程图 ...