转录组测序是基于高通量测序技术，对特定生物样本中所有RNA转录本进行测序，从而获取基因表达水平、转录本结构变异等信息。这种方法具有高通量、高灵敏度和高分辨率的特点，能够全面反映生物体内转录水平的动态变化。蛋白组测序则是利用质谱技术等方法，对生物样本中的蛋白质进行定性和定量分析。蛋白组测序能够直接反映蛋白质...
蛋白组和转录组联合分析，旨在将蛋白质组学和转录组学的数据结合起来进行分析。转录组指给定生物或实验样品中存在的所有核糖核酸（RNA）转录本。目前，可以通过与筛选DNA相似的策略，即微阵列和测序技术，捕获几乎全部的转录组。其中转录组测序更为全面，可以实现覆盖率更高的基本捕获任何形式的RNA。蛋白质组是给定细胞...
1.转录组:通过RNA测序(RNA-seq)获取mRNA表达数据。 2.蛋白组:通过质谱(MS)或蛋白质芯片获取蛋白质表达数据。 二、数据预处理 1.质量控制、标准化和归一化处理。 2.去除噪音和低质量数据。 三、数据整合与分析 1.差异表达分析:识别在不同条件下显著变化的基因和蛋白质。 2.共表达网络构建:构建基因与蛋白质的...
转录组与蛋白组联合分析九象限图 转录组与蛋白组分别从RNA和蛋白质水平对样本进行研究，转录组主要是基因的表达情况，蛋白组主要是转录组的翻译情况，将两者进行整合分析即转录组与蛋白组联合分析，可以对两者的数据进行差异分析，从众多候选基因中快速寻找与研究性状相关的关键基因。由于翻译调控机制的存在，实际上蛋白组...
蛋白组和转录组联合分析,旨在将蛋白质组学和转录组学的数据结合起来进行分析。转录组指给定生物或实验样品中存在的所有核糖核酸(RNA)转录本。目前,可以通过与筛选DNA相似的策略,即微阵列和测序技术,捕获几乎全部的转录组。其中转录组测序更为全面,可以实现覆盖率更高的基本捕获任何形式的RNA。蛋白质组是给定细胞,组织...
蛋白组学和转录组学都是获得基因表达情况的重要工具,联合分析蛋白组和转录组数据可以更全面的分析基因的表达情况。百泰派克生物科技提供基于质谱的蛋白质组学研究服务。 蛋白组与转录组的关系 按照中心法则,遗传信息从DNA经过转录传递给RNA,再由RNA翻译形成各种蛋白质,这些蛋白质可以反作用于DNA复制和DNA转录形成RNA的...
共有基因分析 转录组与蛋白组定量关联分析。 mRNA与蛋白表达趋势一致的基因pathway分析。 mRNA与蛋白表达趋势相反的基因pathway分析。 蛋白表达无变化,对差异表达mRNA对应的基因进行pathway分析。 mRNA表达无变化,对差异表达蛋白对应的基因进行pathway分析。 转录组与蛋白组表达模式分析。
研究通过转录组和蛋白质组分析，以及形态分析，对参与硒介导的砷胁迫改善的分子作用进行了探索。补充硒后，研究者观察到砷导致的包括细胞壁和细胞膜分解引起的结构畸形的修复。在As + Se暴露组中，砷转运蛋白基因NIP1; 1、NIP2; 1、ABCG5、NRAMP1、NRAMP5、TIP2; 2以及硫酸盐转运蛋白SULTR3; 1和SULTR3; 6...
转录组与蛋白组分别从RNA和蛋白质水平对样本进行研究,转录组主要是基因的表达情况,蛋白组主要是转录组的翻译情况,将两者进行整合分析即转录组与蛋白组联合分析,可以对两者的数据进行差异分析,从众多候选基因中快速寻找与研究性状相关的关键基因。 由于翻译调控机制的存在,实际上蛋白组与转录组的数据相关性较低,九象限图...
1、iTRAQ分析共鉴定5357个蛋白,并对这些蛋白在两个差异组合中的上下调情况进行具体的统计;同时转录组测序,按照无参组进行unigene库组装,并进行差异分析,共鉴定出4073(SP1_TP1)和7223(SP2_TP2)个差异基因,进一步分析这些差异基因的上下调情况。 2、蛋白丰度与基因表达水平的比较分析 ...