单细胞转录组与蛋白质组的联合运用,能够有效整合多维度信息,进而提升对生物学过程的解析能力。一方面,通过关联二者的数据,可以更为准确地推断差异蛋白的细胞来源,为深入探究细胞间的调控网络提供关键线索;另一方面,这种联合方式有助于在众多潜在分子中筛选出具有生物标识功能的分子,通过相互印证和补充,进一步明确候选生物标...
本研究使用CRISPR/Cas9系统建立巨噬细胞特异性ADAM8敲除小鼠(ADAM8flox/flox,Lyz2-Cre,KO)和相应的对照小鼠(ADAM8flox/flox,flox),使用蛋白质组学、RNA测序和免疫共沉淀/质谱(COIP/MS)来探索相关的潜在机制。结果发现心肌梗死后心脏巨噬细胞中 ADAM8 增加。巨噬细胞中的 ADAM8-ANXA2-mTOR 自噬轴负责调节心肌梗...
单细胞转录组与蛋白质组的联合运用,能够有效整合多维度信息,进而提升对生物学过程的解析能力。一方面,通过关联二者的数据,可以更为准确地推断差异蛋白的细胞来源,为深入探究细胞间的调控网络提供关键线索;另一方面,这种联合方式有助于在众多潜在分子中筛选出具有生物标识功能的分子,通过相互印证和补充,进一步明确候选生物标...
(1)两组学的联合分析可以获得基因的转录组与蛋白组学表达水平,实现两者的互补,对特定状态下生物体中mRNA和蛋白质表达水平进行全方位分析。 (2)将转录组和蛋白组联合分析可以获得对差异表达的深层分析,挖掘受转录后调控的差异基因或差异蛋白,寻找并验证某些重要的调控通路。 (3)对于那些蛋白数据库缺乏或注释不全的物...
综上所述,“转录组+蛋白组”联合分析表明YB-1在胶质母细胞瘤形成过程中可能参与的调控通路,为揭示YB-1/CCT4/mLST8/mTOR通路在促进胶质母细胞瘤生长中的作用提供了重要的研究方向。 进阶转录组+蛋白组联合分析案例 银耳(Tremella fuciformis)的主要活性成分岩藻多糖(TPS)已被报道具有抗氧化、抗炎、抗肿瘤、抗群体...
三、联合分析的意义 蛋白组与转录组测序的联合分析有助于揭示基因表达调控的完整过程。转录组测序能够捕捉到基因转录水平的动态变化，而蛋白组测序则直接反映蛋白质的种类和数量。通过联合分析，我们可以更全面地了解从基因转录到蛋白质合成的整个过程，揭示其中涉及的复杂调控机制。联合分析有助于发现新的生物标志物和...
1、蛋白组与转录组测序的联合分析有助于揭示基因表达调控的完整过程。转录组测序能够捕捉到基因转录水平的动态变化,而蛋白组测序则直接反映蛋白质的种类和数量。通过联合分析,我们可以更全面地了解从基因转录到蛋白质合成的整个过程,揭示其中涉及的复杂调控机制。
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; ...
图8 差异蛋白的注释和富集分析 (7)蛋白质组学和转录组学结果之间的相关性 比对二次刺激后MRL/lpr小鼠BMDM中显著上调的基因和蛋白质(所有三个比较中上调的DEG和DEP),发现5个分子(Calhm6,Isg15,Gbp2,Iigp1,Ifi47)在转录组和蛋白质组中一致上调,而1个分子(Samhd1)在蛋白质组中下调,在转录组中上调。
转录组和蛋白组分析是研究真核生物基因组的两种最重要的技术之一,转录组法可以反映mRNA的表达状态,从而获得基因的功能;而蛋白组分析法能够反映蛋白质的表达状态,因此可以获得蛋白质的结构和功能。 联合分析是利用转录组与蛋白组联合对基因和蛋白质进行系统分析的一种方法。通过联合分析基因与蛋白质的关系,可以获得基因...