(2)一次刺激与二次刺激后BMDM的转录组学分析 将MRL/lpr小鼠的BMDM分为对照组(A)、一次刺激组(B)和二次刺激组(C),(见图1),并进行转录组学分析。结果发现,与未刺激的BMDM相比,在一次刺激和二次刺激时,有某些共同的差异基因参与了组蛋白甲基化和乙酰化过程。 图4 MRL/lpr小鼠BMDM二次刺激后的转录组学分析...
基于GO富集分析将DEGs进一步分类为113个子集,分析它们在种子成熟过程中的功能作用及相关分子机制,KEGG富集分析对这些DEGs在油茶种子主要代谢过程涉及的分子机制提供参考信息(图3A)。 (3)代谢相关基因相互作用网络分析 黄酮、黄酮醇以及异黄酮类生物合成途径中分别检测到37、9和4个DEGs,构建了蛋白质相互作用(PPI)网络图,...
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; (3)分析不同作用因子...
转录组蛋白组联合分析香螺是一种肉食性螺类,主要生活在温带海水中,市场价值非常高,目前主要靠捕捞获取,工厂化养殖较少.香螺的繁殖能力较弱,本研究通过对香螺胚胎发育的研究,旨在为香螺人工繁殖提供理论依据.本实验以香螺为研究对象,在前期研究基础上,采用电镜技术研究卵囊中营养卵和可育卵形态学差异,解析营养卵和可育...
蛋白组和转录组联合分析,旨在将蛋白质组学和转录组学的数据结合起来进行分析。转录组指给定生物或实验样品中存在的所有核糖核酸(RNA)转录本。目前,可以通过与筛选DNA相似的策略,即微阵列和测序技术,捕获几乎全部的转录组。其中转录组测序更为全面,可以实现覆盖率更高的基本捕获任何形式的RNA。蛋白质组是给定细胞,组织...
不同pH值下培养的桔青霉菌转录组数据分析显示,由于一些代谢途径相关酶的低表达而导致酸性pH抑制毒素合成。此外,酸性环境下培养的桔青霉菌抑制了参与毒素生物合成调控的一些基因的表达水平;这也可以减少毒素的合成。DEGs GO分类最丰富的类别,包括氨基酸转运和代谢,碳水化合物的运输和代谢,无机离子转运和代谢,次生...
最新研究通过大规模的蛋白转录组,及代谢组学的联合分析,揭示了长新冠症状的发生和持续背后的免疫机制,并找到诊断生物标志物和潜在治疗靶点。为长新冠的临床诊治新思路提供基础。张文宏团队自2022年启动研究,通过对21826名首次感染新冠的患者的流行病学及临床特征分析,发现近9%的患者在感染后6个月报告了长新冠症状,其中...
随着全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多。然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研究组、研究员...
(2)一次刺激与二次刺激后BMDM的转录组学分析 将MRL/lpr小鼠的BMDM分为对照组(A)、一次刺激组(B)和二次刺激组(C),(见图1),并进行转录组学分析。结果发现,与未刺激的BMDM相比,在一次刺激和二次刺激时,有某些共同的差异基因参与了组蛋白甲基化和乙酰化过程。
抗菌肽P-1粉红单端孢转录组学蛋白组学抑菌机理粉红单端孢(Trichothecium roseum)是侵染多种果蔬发生红粉病的病原菌,还易积累毒素引起人和动物中毒.短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus HN-10)抗菌肽P-1是一种对T.roseum具有很强抑菌活性的新型抗菌肽,但其抑菌机理尚不明确.本试验以T.roseum为研究对象,采用原子吸收光谱...