转录组和蛋白组分析是研究真核生物基因组的两种最重要的技术之一,转录组法可以反映mRNA的表达状态,从而获得基因的功能;而蛋白组分析法能够反映蛋白质的表达状态,因此可以获得蛋白质的结构和功能。 联合分析是利用转录组与蛋白组联合对基因和蛋白质进行系统分析的一种方法。通过联合分析基因与蛋白质的关系,可以获得基因...
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; (3)分析不同作用因子...
与转录组结果类似,作者发现超过20%的蛋白质(2414个蛋白中的513个)在dHC和vHC之间存在差异表达(p <0.005,log2FC >±0.3)(图1E)。接着将转录组数据和蛋白质组数据联合分析发现,有171个基因在mRNA和蛋白质表达水平均发生了显著变化(图1G),其中有151个基因的mRNA和蛋白质表达呈正相关(r =0.56, n = 171,p...
(2)一次刺激与二次刺激后BMDM的转录组学分析 将MRL/lpr小鼠的BMDM分为对照组(A)、一次刺激组(B)和二次刺激组(C),(见图1),并进行转录组学分析。结果发现,与未刺激的BMDM相比,在一次刺激和二次刺激时,有某些共同的差异基因参与了组蛋白甲基化和乙酰化过程。 图4 MRL/lpr小鼠BMDM二次刺激后的转录组学分析...
本研究使用亚硒酸盐和硒酸盐处理茶树后进行了转录组和蛋白质组测序和分析,获得了差异表达基因和差异表达蛋白。GO分析结果表明,Na2SeO3处理后,氨基酸和蛋白代谢、还原反应强烈上调。KEGG分析结果表明,参与氨基酸和谷胱甘肽代谢的基因上调,参与...
通过转录组和蛋白质组联合分析,挖掘了参与CPT生物合成相关基因的表达模式(图4)。在转录水平上,10OMT和STR分别在E和YL中具有最高的表达水平,而其相应蛋白质的丰度在茎中最高。这一现象反映了CPT生物合成在转录后和翻译水平上可能存在复杂的分级调控。
在本研究中,我们构建了激光诱导的CNV小鼠模型,然后结合蛋白质组学和转录组学(即蛋白质转录组)分析,以确定CNV发病所涉及的核心基因,生物过程和信号通路。此外,我们重点关注干扰素β(IFN-β)的功能以及CNV的相关潜在治疗。 研究思路 研究结果 1. 转录本改变和CNV视网膜中富集的生物学途径 ...
为了探究蛋白质组亚型和磷酸化蛋白质组亚型对itraq结果的前436种不同表达的蛋白质进行聚类分析发现了两个不同的集群一类包含所有basal和唯一的cldnlow乳腺肿瘤whim12另一类包含所有luminalb和her2e乳腺肿瘤 蛋白组和转录组联合分析如何搞事情? 蛋白质是生命功能的执行者,其含量的变化在生物体的生长、环境应激、疾病...
且从DNA、mRNA到蛋白质的过程中涉及到一整套精细的表达调控机制,如转录调控、转录后调控、翻译调控、翻译后调控等。因此,要全面探究生物体疾病机理、环境应激、生长发育机制等,精细描绘关键基因的表达模式,同步检测mRNA和蛋白质的表达量并进行联合分析已成为当前研究的必然趋势。通过蛋白组和转录组的联合分析,我们可以...
步骤1:肥胖小鼠脂肪组织中DHPS和eIF5AHyp水平检测; 步骤2:研究DHPS和eIF5AHyp对促炎型巨噬细胞M1的调控作用; 步骤3:蛋白组学分析:探讨DHPS对M1巨噬细胞炎症信号的转录后调控; 步骤4:转录组学分析:揭示DHPS 对M1巨噬细胞转录水平的影响; 步骤5:DHPS对M1巨噬细胞在炎症过程中浸润到脂肪组织中的调控作用。