搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1631、弹幕量 2、点赞数 57、投硬币枚数 27、收藏人数 167、转发人数 21, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
为了验证鉴定小鼠interneurons的Dlx1/2调控网络,作者分析了人脑的sNuc-Seq(Single nuclei RNA-Seq)数据集。 在人类脑sNuc-Seq数据集上,SCENIC也鉴定出由DLX1/2强烈驱动的interneurons细胞群,该群具有与小鼠相同的motif,并且识别出一组保守的靶标,包括DLX1本身。 接下来,作者将这种跨物种分析扩展到其他细胞类型。与基...
懿贝瑞:Single-Cell RNA-Seq助力肿瘤突变抗原特异性TCRs的发现 众所周知,T-cell receptors(TCR)的作用是识别抗原,在肿瘤免疫治疗当中发挥着重要作用。TCR分为两类:TCR1和TCR2,TCR1由γ和δ两条链组成,TCR2由α和β两条链组成。外周血中的T细胞有90%-95%表达TCR2,而且单个T细胞只表达TCR1和TCR2中的一个,...
How does GEM-X help you detect fragile, low RNA–content cells? GEM-X增加了对脆弱、低RNA含量细胞的检测,扩大了发现潜力。由于细胞在GEM-X微流控芯片中的通道中移动得更快,脆弱的细胞在悬浮中的时间更短,可以被保存下来;高灵敏度确保检测到低RNA含量的细胞。 捕获这些细胞增加了原先技术无法捕获的细胞类型...
使用single-cell RNA-seq能够从海量的单细胞数据中揭示组织中不同细胞类型,以及同一细胞中不同基因的表达情况。这篇文章通过单细胞RNA-seq构造了小鼠雄性生殖细胞分化发育的表达动态图谱,揭示了关键调控因子,并且提供了一种分离最后阶段圆形精子的表面标...
使用R语言介绍单细胞RNA-Seq数据的差异表达特征及聚类识别 252 -- 21:55 App 介绍数种单细胞数据处理的软件 浏览方式(推荐使用) 哔哩哔哩 你感兴趣的视频都在B站 打开信息网络传播视听节目许可证:0910417 网络文化经营许可证 沪网文【2019】3804-274号 广播电视节目制作经营许可证:(沪)字第01248号 增值电信业务...
批量RNA-seq分析提取样本中的所有RNA，可能包含数万或数十万个细胞，然后对RNA进行序列分析。然而，这种...
2.之后加入的template-switching oligonucleotide(TSO)引物,由于在合成时携带3个RNA碱基G,会同第一链cDNA末端多加的C碱基杂交,顺理成章地将模板转换成第一链cDNA,而不是再使用RNA酶将RNA降解后使cDNA上位为模板。这样,我们就有了双链的cDNA。 可以看到,由于START-seq是要做高通量的单细胞测序,因此,在TSO引物(图...
Picelli, Set al. Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2.Nature Protocols. 2014 Jan;9(1):171-81. Partial results are shown below: 1. What is the purpose of single-cell RNA sequencing? The purpose of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) is to delve into the intricate...
首先我们先来回顾一下上一期讲到的Single cell RNA-seq 的原理,首先是2006年末端加A形成第一链cDNA的方法奠定了后来的单细胞转录组测序的问世,2009年,二代测序的发展结合末端加A的思路成就了第一篇单细胞转录组文章,2011年富集5端的带细胞Barcode的模板转换法原理启发了之后一大批单细胞转录组方法的建立。2012年,...