搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1685、弹幕量 3、点赞数 57、投硬币枚数 27、收藏人数 167、转发人数 21, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
为了验证鉴定小鼠interneurons的Dlx1/2调控网络,作者分析了人脑的sNuc-Seq(Single nuclei RNA-Seq)数据集。 在人类脑sNuc-Seq数据集上,SCENIC也鉴定出由DLX1/2强烈驱动的interneurons细胞群,该群具有与小鼠相同的motif,并且识别出一组保守的靶标,包括DLX1本身。 接下来,作者将这种跨物种分析扩展到其他细胞类型。与基...
How does GEM-X help you detect fragile, low RNA–content cells? GEM-X增加了对脆弱、低RNA含量细胞的检测,扩大了发现潜力。由于细胞在GEM-X微流控芯片中的通道中移动得更快,脆弱的细胞在悬浮中的时间更短,可以被保存下来;高灵敏度确保检测到低RNA含量的细胞。 捕获这些细胞增加了原先技术无法捕获的细胞类型...
介绍为什么要做单细胞rna测序,以及具体如何做, 视频播放量 128、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 5、转发人数 0, 视频作者 小云爱生信, 作者简介 我司将持续更新生物信息学,相关视频,文章,关注可私信提问哦!,相关视频:RNAseq数据中Fastq到count教程,从
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物...
CEL-seq2优化了反转引物的长度,并使用SuperScript II Double-Stranded cDNA Synthesis Kit来进行一链,二链的合成(上一篇推文有同学问到二链合成的问题,这里介绍下,cDNA第二链合成的原理是用RNase H使RNA-DNA杂合链中的RNA产生切口,再用DNA Polymerase I通过切口平移(nick translation)反应进行RNA链取代合成cDNA第二...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。 目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...
CEL-seq2使用体外逆转录的扩增方法,同时引入了UMI (unique molecular identifiers),使用UMI计数RNA的Transcripts数在2012年发表于Nature Method,UMI也被后来的几乎所有的单细胞高通量转录组测序方法所使用。 还是从细胞里的mRNA出发,这里用于反转的oligo-dT引物这一次组件丰富许多,带有Barcode,UMI,测序接头,还有就是T7启...
懿贝瑞:Single-Cell RNA-Seq助力肿瘤突变抗原特异性TCRs的发现 众所周知,T-cell receptors(TCR)的作用是识别抗原,在肿瘤免疫治疗当中发挥着重要作用。TCR分为两类:TCR1和TCR2,TCR1由γ和δ两条链组成,TCR2由α和β两条链组成。外周血中的T细胞有90%-95%表达TCR2,而且单个T细胞只表达TCR1和TCR2中的一个,...
首先我们先来回顾一下上一期讲到的Single cell RNA-seq 的原理,首先是2006年末端加A形成第一链cDNA的方法奠定了后来的单细胞转录组测序的问世,2009年,二代测序的发展结合末端加A的思路成就了第一篇单细胞转录组文章,2011年富集5端的带细胞Barcode的模板转换法原理启发了之后一大批单细胞转录组方法的建立。2012年,...