2017年发表在Nature Methods杂志上的SCENIC[1]算法,利用单细胞RNA-seq数据,同时进行基因调控网络重建和细胞状态鉴定,应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据,提出并证明了顺式调控网络分析能够用于指导转录因子和细胞状态的鉴定。SCENIC通过使用生物学驱动的features自动清除肿瘤样本特异性等批次效应。 基因调控网络 我们要深刻...
Learn how Milo detects targets in single-cell sequencing runs and provides single-cell protein expression information to validate single-cell RNA-seq data.
GEM-X Single Cell Immune Profiling v3 (5’ v3) allows you to maximize biological insights from clinical samples. Renal cell carcinoma dissociated tumor cells were loaded separately onto a Next GEM Chip K (10,000 cells) and a GEM-X 5' chip (20,000 cells), and then processed on a Chromi...
研究人员针对 scRNA-seq 数据血液污染问题,开发 Originator 工具分离免疫细胞,提升数据质量。 在生命科学研究中,单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术为探索复杂组织的细胞奥秘打开了一扇窗。然而,在对复杂(如胎盘)或天然混合(如肿瘤)组织进行 scRNA-seq 数据分析时,却遇到了大麻烦。很多组织里都有血管,这就导致 scRN...
Frequently asked questions around next-generation sequencing and single-cell RNA-seq sample preparation and order processing.
In 2009, the single-cell RNA sequencing method (scRNA-seq) was developed in the advent of the increasing affordability of sequencing methods. Bulk RNA sequencing usually masks uniqueness and fails to show latent changes in cells. In response to this, scRNA-seq has emerged to uncover this unique...
搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1927、弹幕量 4、点赞数 62、投硬币枚数 27、收藏人数 175、转发人数 24, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。 目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...
single cell RNAseq小云爱生信 立即播放 打开App,流畅又高清100+个相关视频 更多 222 0 45:32 App 单细胞聚类分析 284 0 01:01:17 App Vizgen单细胞研讨会 710 0 09:48 App 利用StemCell包进行单细胞测序分析 494 0 01:29:30 App 简介单细胞测序数据去批次校正和聚类分析 168 0 33:53 App 胰腺导管...
单细胞RNA测序(scRNA-seq )是一个飞速发展的领域,该技术帮助科研人员从一堆细胞(bulk)水平精细到单细胞(single-cell)水平研究基因的表达状态,从而可以更加精细的刻画科研对象的分子状态(例如细胞图谱,表达特征等)。目前该领域涌现了一大批用于单细胞RNA测序分析的方法,随着越来越多方法的出现,如何选择和组合使用这些方...