近日,来自德国分子生物学研究所的Petra Beli团队以K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution为题在Molecular Cell杂志发表了其最新的研究成果,他们发现甲醛能够诱导RNA-蛋白质交联物(RNA-protein crosslinks,RPCs)并停滞核糖体,抑制蛋白质翻译。另外,在mRNA上的RPCs能够核糖体...
近日,来自德国分子生物学研究所的Petra Beli团队以K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution为题在Molecular Cell杂志发表了其最新的研究成果,他们发现甲醛能够诱导RNA-蛋白质交联物(RNA-protein crosslinks,RPCs)...
一、实验原理紫外交联仪的实验原理是利用紫外线照射将RNA与蛋白质进行交联。在实验中，先将样本进行紫外线照射，使RNA与蛋白质的分子链产生共价结合，从而将它们长久地连接在一起。这种交联反应可以在细胞或组织样本中的RNA和蛋白质之间建立长久的相互作用关系。二、实验步骤 1.样本准备在进行紫外交联实验之前，首先需要...
他们首先用甲醛处理细胞半个小时或者用核苷酸类似物4-SU(能够被特异性地整合至RNA中)处理细胞16小时后用UVA辐照细胞来诱导RNA-蛋白质交联产生。随后利用protein-x-linked RNA extraction(XRNAX)方法提取甲醛处理组及PAR-CL(4-SU+UVA)...
“Angewandte Chemie International Edition”上的文章,题名为“Photocatalytic ChemicalCrosslinking for Profiling RNA–Protein Interactionsin Living Cells “在这篇文章中,该课题组开发了一种光催化交联 (PhotoCAX) 策略,结合质谱 (PhotoCAX-MS) 和 RNA 测序 (PhotoCAX-seq) 来研究蛋白质-RNA 相互作用的组成和...
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA相互作用(1)|亚甲基蓝 实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的
用蛋白酶 K 消化 RNA-蛋白交联物,生成的 RNA-蛋白交联物中的多肽仅含存较少的氨基酸:用 50 μl 蛋白酶 K 反应缓冲液重悬从胶中纯化得到的 RNA-蛋白交联物,加入 1 μl 蛋白酶 K 储存液(2.5 mg/ml ),于 37℃ 反应 30 min。 乙醇沉淀 RNA-蛋白交联物(方法同前),变性胶电泳纯化 RNA 产物(方法同前...
生化机理 2-亚氨基硫杂环戊烷盐酸盐,一种蛋白质修饰试剂,通常用于将硫醇基团连接到蛋白质和肽上。用 2-IT 修饰的毛发角蛋白纤维的拉曼光谱分析。HCl 显示出新的二硫化物基团的形成。RNA-蛋白质交联(巯基加成)剂。与伯胺反应。保持类似于原始氨基的电荷性质。 一般描述 2-Iminothiolane, Hydrochloride is a thiola...
核酸凝胶电泳实验:能够固定凝胶中的核酸分子,使其发生化学交联,有助于后续对核酸分子的染色和分析,提高实验的准确性和可靠性。 CLIP - seq实验(紫外交联免疫沉淀结合高通量测序):基于RNA分子与RNA结合蛋白在254nm紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA - 蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加...
B、紫外线交联免疫共沉淀(CLIP)已被开发为使用UV测定RNA-蛋白质复合物体内交联的常用方法,B正确; C、RNA pull-down实验是一种用于寻找RNA靶标的实验方法,它结合了RNA杂交技术和亲和层析技术,该实验的主要原理是利用一种与目标RNA互补的DNA探针固定在琼脂糖珠上,通过混合样品中的RNA和蛋白质来鉴定RNA的结合伴侣,可...