1. RNA与蛋白质的互作方式 RNA与蛋白质之间的互作是基于它们之间的化学结构相互配对的。RNA分子具有多种不同的结构,其中最常见的是单股线性结构和双股线性结构。蛋白质是由氨基酸单元组成的长链,具有三级结构:一级结构是氨基酸序列,二级结构是α-螺旋或β-折叠,三级结构是蛋白质的整体立体构象。RNA与蛋白质之间的互...
在TH的74个蛋白质带有注释的结构域(RNA-binding domains (RBDs)),这74种蛋白质由98个含蛋氨酸的肽命中表示,其中66个含甲硫氨酸的肽中有49个被定位到已知的RBD,这表明TH RNA和这些蛋白质相互作用体具有新的相互作用表面。这些定位的RNA结合结构域包括RNA识别基序(RRM)(21肽)、解旋酶结构域(7肽)、双链RNA结合...
这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上,这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起,这一过程被称为“RNAylation”。2022年有两篇文章相继报道了RNAylatio...
作者发现了其中一种名为ModB的ART,可以接受NAD或NAD-RNA作为底物,并将RNA链转移给特定的核糖体蛋白质rS1和rL2。 首先,作者利用放射性标记的NAD-RNA和荧光标记的NAD-RNA作为底物,发现ModB可以将RNA链转移给rS1,这与ModB使用NAD作为...
近日,德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队的上述工作以A viral ADP-ribosyltransferase attaches RNA chains to host proteins为题正式发表在了Nature上。该研究发现一种噬菌体来源的ADP-核糖基转移酶(adenosine diphosphate (ADP)-ribosyltransferases,ART)可以将自身RNA链与细菌宿主蛋白质连接在一起,即上...
以下是一些RNA与蛋白质互作调控的新范式: 1. 蛋白质-RNA复合物:蛋白质和RNA在细胞内形成复杂的复合物,这些复合物在基因表达、细胞代谢等过程中起着重要的调控作用。例如,一些蛋白质可以与mRNA结合,通过影响mRNA的稳定性、翻译效率等方式调控基因表达。 2. RNA结合蛋白:一些蛋白质可以与特定的RNA序列结合,形成RNA-...
蛋白质与RNA之间的相互作用影响着翻译、基因信息修复等关键的生命进程。这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上,这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起,...
蛋白质与RNA互作是指蛋白质与RNA分子之间的相互作用。这种互作在生物体内广泛存在,参与基因表达调控、RNA加工和转运等多种生命过程。蛋白质通过与RNA结合,影响RNA的结构和功能,进而调控生物体的生理和病理过程。 那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢?
RNA-蛋白质相互作用在转录后基因调控中至关重要。随着RNA测序技术和高效液相质谱联用的蛋白质组学技术的快速发展,将这些创新的化学生物工具与生物学研究相结合,预示了在细胞水平研究分子的互作将成为可能。本文作者描述了蛋白质组学和转录组学方法在开发和应用细胞RNA-蛋白质互作方面的最新研究进展,重点聚焦基于测序技术...