在TH的74个蛋白质带有注释的结构域(RNA-binding domains (RBDs)),这74种蛋白质由98个含蛋氨酸的肽命中表示,其中66个含甲硫氨酸的肽中有49个被定位到已知的RBD,这表明TH RNA和这些蛋白质相互作用体具有新的相互作用表面。这些定位的RNA结合结构域包括RNA识别基序(RRM)(21肽)、解旋酶结构域(7肽)、双链RNA结合...
这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上,这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起,这一过程被称为“RNAylation”。2022年有两篇文章相继报道了RNAylatio...
如果蛋白质能和这个RNA结合,就会影响荧光素酶的表达,那我们通过检测荧光的强度就能知道蛋白质和RNA的互作情况啦。这个方法很灵敏,能检测到比较微弱的相互作用。不过呢,它只能检测到对基因表达有影响的相互作用,如果蛋白质和RNA的互作不影响基因表达,可能就检测不到了。
蛋白质和RNA是具有紧密关系的生物分子,能够通过物理相互作用参与完成细胞的周期并调控细胞的生物学过程。如果干扰了它们的正常相互作用,将会导致细胞功能紊乱,影响植物的生长发育。因此,研究RNA与蛋白质的相互作用,对于理解细胞内分子调控机制和植物的生长发育机理具有重要意义。 以蛋白质为中心鉴定与蛋白质结合的RNA,传统...
蛋白质-RNA互作在基因表达调控中的作用 1.蛋白质-RNA互作在转录后调控中起着关键作用,如mRNA的剪接、稳定性和定位。 2.研究表明,多种转录因子和调控蛋白通过识别特定的RNA序列来调节基因表达。 3.蛋白质-RNA互作在细胞周期的调控、应激反应和发育过程中也发挥着重要作用。 蛋白质-RNA互作的生物信息学分析 1.生物...
蛋白质和RNA是具有紧密关系的生物分子,能够通过物理相互作用参与完成细胞的周期并调控细胞的生物学过程。如果干扰了它们的正常相互作用,将会导致细胞功能紊乱,影响植物的生长发育。因此,研究RNA与蛋白质的相互作用,对于理解细胞内分子调控机制和植物的生长发育机理具有重要意义。
近日,德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队的上述工作以A viral ADP-ribosyltransferase attaches RNA chains to host proteins为题正式发表在了Nature上。该研究发现一种噬菌体来源的ADP-核糖基转移酶(adenosine diphosphate (ADP)-ribosyltransferases,ART)可以将自身RNA链与细菌宿主蛋白质连接在一起,即上...
蛋白质与RNA之间的相互作用影响着翻译、基因信息修复等关键的生命进程。这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上,这篇文章中德国海德堡大学Katharina ...
1. RNA与蛋白质的互作方式 RNA与蛋白质之间的互作是基于它们之间的化学结构相互配对的。RNA分子具有多种不同的结构,其中最常见的是单股线性结构和双股线性结构。蛋白质是由氨基酸单元组成的长链,具有三级结构:一级结构是氨基酸序列,二级结构是α-螺旋或β-折叠,三级结构是蛋白质的整体立体构象。RNA与蛋白质之间的互...
以下是一些RNA与蛋白质互作调控的新范式: 1. 蛋白质-RNA复合物:蛋白质和RNA在细胞内形成复杂的复合物,这些复合物在基因表达、细胞代谢等过程中起着重要的调控作用。例如,一些蛋白质可以与mRNA结合,通过影响mRNA的稳定性、翻译效率等方式调控基因表达。 2. RNA结合蛋白:一些蛋白质可以与特定的RNA序列结合,形成RNA-...