比如说,我们想研究某个特定的蛋白质A和RNA的互作,就可以用针对蛋白质A的抗体。这个方法就像是用一个小钩子(抗体)把我们感兴趣的蛋白质连同和它“关系密切”的RNA一起钩出来,然后我们就可以通过一些后续的检测手段,像测序啊之类的,去看看被钩出来的是哪些RNA啦。不过呢,这个方法也有小缺点,就是它可能会有一些非...
这些相互作用是基于特定RNA结构或序列的RNA与RNA结合蛋白之间的短暂接触。事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上，这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起，这一过程被称为“RNAylation”。2022年有两篇文章相继报道了RNAylatio...
蛋白质-RNA互作在基因表达调控中的作用 1.蛋白质-RNA互作在转录后调控中起着关键作用,如mRNA的剪接、稳定性和定位。 2.研究表明,多种转录因子和调控蛋白通过识别特定的RNA序列来调节基因表达。 3.蛋白质-RNA互作在细胞周期的调控、应激反应和发育过程中也发挥着重要作用。 蛋白质-RNA互作的生物信息学分析 1.生物...
以下是一些RNA与蛋白质互作调控的新范式: 1. 蛋白质-RNA复合物:蛋白质和RNA在细胞内形成复杂的复合物,这些复合物在基因表达、细胞代谢等过程中起着重要的调控作用。例如,一些蛋白质可以与mRNA结合,通过影响mRNA的稳定性、翻译效率等方式调控基因表达。 2. RNA结合蛋白:一些蛋白质可以与特定的RNA序列结合,形成RNA-...
RNA与蛋白质的相互作用对整个生物学中的RNA功能至关重要。通常依赖于亲和力纯化的传统策略也倾向于检测高亲和力相互作用,可能会错失一些具有生物学重要性的较弱相互作用。 2024年2月,来自杜克大学化学系的Amanda E. Hargrove教授和Michael C. Fitzgeral教授课题组将稳定性的质谱法首次应用在分析RNA-蛋白相互作用中,该...
1. RNA与蛋白质的互作方式 RNA与蛋白质之间的互作是基于它们之间的化学结构相互配对的。RNA分子具有多种不同的结构,其中最常见的是单股线性结构和双股线性结构。蛋白质是由氨基酸单元组成的长链,具有三级结构:一级结构是氨基酸序列,二级结构是α-螺旋或β-折叠,三级结构是蛋白质的整体立体构象。RNA与蛋白质之间的互...
蛋白质和RNA是具有紧密关系的生物分子,能够通过物理相互作用参与完成细胞的周期并调控细胞的生物学过程。如果干扰了它们的正常相互作用,将会导致细胞功能紊乱,影响植物的生长发育。...
1. RNA和蛋白质的相互作用 RNA和蛋白质之间的相互作用方式多种多样,这些互作机制包括直接互作、间接互作和辅助互作。其中,直接互作是最为普遍的一种模式,包括RNA与蛋白质的物理化学上的相互作用,如静电作用、氢键作用、范德华作用和疏水作用等。另外,RNA和蛋白质还可以通过识别特定的结构域、序列或组合结构来实现互相...
互作网路中心的节点分别代表新冠肺炎病毒(橙色)、寨卡病毒(蓝色)和埃博拉病毒(绿色)RNA。橙色连接线表示病毒RNA-宿主蛋白质的互作。蓝色连线代表宿主蛋白质-蛋白质间的互作。蛋白复合物或参与相同生物学通路的蛋白质用虚线框指示。节点的颜色由深到浅根据MiST分数标注。潜在的具有靶向药物的宿主蛋白质采用红色圆标注。
实操正文如下:蛋白质与RNA互作是指蛋白质与RNA分子之间的相互作用。这种互作在生物体内广泛存在,参与基因表达调控、RNA加工和转运等多种生命过程。蛋白质通过与RNA结合,影响RNA的结构和功能,进而调控生物体的生理和病理过程。那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢?第一步,通过Uniport网站获取候选基因的蛋白质序列(...