事实上今天我们要介绍的文章在2021年就投稿到了bioRxiv上，这篇文章中德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队发现蛋白质和RNA也可以通过共价键紧密结合在一起，这一过程被称为“RNAylation”。2022年有两篇文章相继报道了RNAylation过程对于生物学进程的重要性（详见Cell | 饶子和/娄智勇等发现生物界中...
沙特阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)高欣课题组(http://sfb.kaust.edu.sa)与香港科技大学黄旭辉课题组和南方科技大学陈炜课题组合作,提出一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合偏好的预测方法。该方法基于特征向量,将蛋白质表面结构的局部理化特性编码为高维度的输入向量,使用ResNet提取特征,最后利用多层分类器预测出蛋白质表面...
核输入和输出都受到核转运蛋白的严格控制，从而凸显了这些蛋白质作为各种疾病包括癌症治疗靶点的重要性。如前文所说，较大的蛋白质和RNA需要核转运蛋白介导的能量依赖性主动转运，从而完成进出细胞核的过程。其中，XPO1是一种核输出蛋白，属于核转运蛋白的importin-β超家族，能够识别货物蛋白的核输出序列。在输出蛋白中...
与传统的RNA蛋白质相互作用分析方法相比,TREX技术能够更加精确地识别出与特定RNA区域直接相互作用的蛋白质,无论这些相互作用发生在细胞的哪个部位,都能被有效捕获和鉴定。通过利用RNase H酶特异性地降解与DNA探针杂交的RNA区域,TREX技术不仅可以揭示已知的RNA-蛋白质相互作用,还能发现新的、未被发现的相互作用,为我们理...
这个过程一步步进行，最终生成了一条短的氨基酸链，即迷你蛋白质——肽，并附着在RNA上。氨基酸间化学键的形成需要能量，研究人员则通过在溶液中用各种反应物激发氨基酸来提供能量。Martin表示，这是一个非常令人兴奋的发现。“不仅因为它为基于RNA的肽的形成指明了一条新路径，还揭示了自然发生的RNA修饰碱基的新的...
RNA与蛋白质的相互作用对整个生物学中的RNA功能至关重要。通常依赖于亲和力纯化的传统策略也倾向于检测高亲和力相互作用,可能会错失一些具有生物学重要性的较弱相互作用。 2024年2月,来自杜克大学化学系的Amanda E. Hargrove教授和Michael C. Fitzgeral教授课题组将稳定性的质谱法首次应用在分析RNA-蛋白相互作用中,该...
近日,德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队的上述工作以A viral ADP-ribosyltransferase attaches RNA chains to host proteins为题正式发表在了Nature上。该研究发现一种噬菌体来源的ADP-核糖基转移酶(adenosine diphosphate (ADP)-ribosyltransferases,ART)可以将自身RNA链与细菌宿主蛋白质连接在一起,即上...
近日,德国海德堡大学Katharina Höfer和Andres Jäschke团队的上述工作以A viral ADP-ribosyltransferase attaches RNA chains to host proteins为题正式发表在了Nature上。该研究发现一种噬菌体来源的ADP-核糖基转移酶(adenosine diphosphate ...
美国佐治亚理工学院生物物理化学家Loren Williams对此表示赞同,他认为,如果RNA的起源和蛋白质的起源是联系在一起的,而且它们的出现不是独立的,那么这就会从根本上转向支持“RNA -蛋白质世界”,而远离“RNA世界”。 为了证明这是一种合理的生命起源,科学...
蛋白质和RNA是具有紧密关系的生物分子,能够通过物理相互作用参与完成细胞的周期并调控细胞的生物学过程。如果干扰了它们的正常相互作用,将会导致细胞功能紊乱,影响植物的生长发育。因此,研究RNA与蛋白质的相互作用,对于理解细胞内分子调控机制和植物的生长发育机理具有重要意义。