RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结合得分分布。对于线性RNA,RBPsuite使用iDeepS来预测它们与RBP的结合分数;对于环状RNA(circRNA),RBPsuite使用CRIP预测它们与RBP的结合分数。 话不多说,上链接:...
今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的...
今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结...
RNARNA结合蛋白RNA-蛋白质结合位点深度学习RNA及RNA结合蛋白之间的相互作用在基因调控中扮演着重要角色.许多预测RNA-蛋白质结合位点的深度学习方法陆续提出.目前多数研究没有将RNA结合蛋白作为模型输入,限制了深度学习模型的规模.对此问题,提出一个带有RNA结合蛋白输入的深度学习模型,通过扩大训练集的规模挖掘RNA-蛋白质结合...
因此,如何识别RNA上的RBP结合位点对于后续分析至关重要。今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RB...
蛋白质结合位点预测策略-剖析洞察 蛋白质和RNA结构预测 一种基于深度学习的RNA和蛋白质结合位点的识别方法 蛋白质结合位点的识别与设计 蛋白质结合位点识别-剖析洞察 蛋白质表面模块划分及其在结合位点预测中的应用 一种基于深度卷积神经网络的RNA-蛋白质结合位点预测方法 蛋白质结合的分子进化 动态模拟揭示蛋白质结合位点...
建立了一个全新的RNA结合位点预测模型。结果表明,我们的预测模型净预测值达到了72.2% (敏感性为61.O%,特异性为83.3%)。与之前的同是在氨基酸残基水平上对蛋白质序列中 RNA结合位点进行预测的两个模型相比,我们的模型有更高的准确性和更好的推广性。 在新建立的RNA结合位点预测模型的基础上,我们结合计算机网络技术...
一种基于卷积神经网络的RNA-蛋白质结合位点预测方法 申请人: 申请号:2021115196170 申请日:2024-10-22 专利类型:发明 专利价格:￥22000 联系方式:13375159536 上架时间:2024-10-24 浏览次数:21 *自主联系卖家线下成单,平台不承担风险,您可以委托平台购买,规避风险...
我们基于PDB结构数据,采用距离定义法来确定与RNA相互作用的氨基酸位点.即对于蛋白质与RNA复合物中的某个氨基酸,如果其包含的至少一个原子与某个RNA碱基所包含的任何一个原子之间的距离小于3.5,那么就认为该氨基酸与RNA相互作用.这样,在90735个氨基酸中,有10525个被判定为RNA结合位点,其余的80210个被判定为非结合位点...
因此,如何识别RNA上的RBP结合位点对于后续分析至关重要。今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite...