今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结...
与之前的同是在氨基酸残基水平上对蛋白质序列中RNA结合位点进行预测的两个模型相比,我们的模型有更高的准确性和更好的推广性。在新建立的RNA结合位点预测模型的基础上,我们结合计算机网络技术,开发了RISP在线预测系统(http://grc.seu edu.cn/dsp)。用户在预测系统输入界面输入任意一条蛋白质序列,就可以得到蛋白质...
蛋白质分子中RNA结合位点的分析和预测-生物化学与分子生物学专业论文.docx,目录 中文摘要1 Abstract 5 第一章 前言9 1.1 实验方法9 1.1.1 X 射线晶体衍射 9 1.1.2 核磁共振10 1.1.3 其它结构测定方法10 1.2 生物信息学方法10 1.2.1 研究蛋白质中的 RNA 结合域 11 1.2.2 通过
蛋白质RNA结合位点分析分析的位点的预测结合位点的分析与 分类号密级 UDC保密期限 博士学位论文 题目蛋白质分子中RNA结合位点的分析和预测 作者姓名** 指导教师李伍举研究员应晓敏副研究员 培养单位军事医学科学院基础医学研究所 专业名称生物化学与分子生物学 ...
3 6 2 9 1 1 1 1 N C CN 111192631 A 权利要求书 1/2页 1.一种构建用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点模型的方法,其中包括如下步骤: 步骤1、获得已知的蛋白质-RNA相互作用的结合位点处及其上下游区域的序列数据,以 及测定的所述蛋白质-RNA相互作用的结合位点及其上下游区域的结构数据; 步骤2、分别基于...
1.一种基于自注意力机制的RNA-蛋白质结合位点预测方法,其特征在于,包括如下步骤: S1:数据获取与预处理:获取RNA与蛋白质结合位点处及其上下游序列数据,并将RNA序列统一为固定的长度; S2:基于k-mer嵌入编码序列数据:对预处理后数据采用滑动窗口法获取序列的k-mer表示,独热向量化k-mer子序列后通过词嵌入降维独热向...
本发明属于生物信息学领域,涉及一种基于注意力机制的RNA蛋白质结合位点预测方法,其中包括卷积神经网络,残差神经网络,注意力机制和RNA序列数据处理等技术,旨在提高深度学习模型对RNA蛋白质结合位点的预测性能.首先,使用长度为101和501个核苷酸长度的窗口分别处理RNA序列;其次,把处理好的2个RNA序列通过单热编码方式编码成2...
基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站--RBPsuite发布于 2022-02-13 15:15 · 1.1 万次播放 赞同4添加评论 分享收藏喜欢 举报 深度学习(Deep Learning)核糖核酸(RNA) 写下你的评论... 暂无评论相关推荐 13:57 第28集-逆转家族遗传病,告别植物神经功能紊乱,还你健康人生! 王...
涉及一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法,用于获取RNA病毒基因序列被选为蛋白质结合位点的概率,该方法包括以下步骤:1)获取多条RNA病毒基因序列;2)以设定的单位长度对每条所述RNA病毒基因序列进行位点信息量计算并比较,获得最大位点信息量及该最大位点信息量所对应的位点信息,根据所述位点信息获得结合位点...
用于构建用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点模型的方法和系统专利信息由爱企查专利频道提供,用于构建用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点模型的方法和系统说明:本发明提供了一种构建用于预测蛋白质‑RNA相互作用结合位点模型的方法和系统,与其对应的还包括使...专利