搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1237、弹幕量 2、点赞数 46、投硬币枚数 25、收藏人数 147、转发人数 11, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
总而言之,选择scRNA-seq还是snRNA-seq,取决于您的样本以及您具体的研究目标。 参考文献 1. Wu H, Kirita Y, Donnelly EL, Humphreys BD. Advantages of single-nucleus over single-cell RNA sequencing of adult kidney: Rare cell types and novel cell states revealed in fibrosis. Journal of the American ...
今年5月,浙江大学医学院附属邵逸夫医院章仲恒教授团队综合单细胞RNA-seq和BulkRNA-seq分析探索了UTI对脓毒症的潜在机制。该研究结果已以论文《Integrated Single Cell and Bulk RNA-Seq Analysis Revealed Immunomodulatory Effects of Uli...
【生信技术】测序数据差异表达分析|导入、加载、整理、分析,RNA-Seq数据的差异分析操作,跟着操作你就对了 231 -- 33:57 App Integrate single-cell RNA-Seq datasets in R using Seurat (CCA) 575 -- 12:56 App (字幕)Single Cell RNA Seqencing(scRNAseq)原理 - Finding a cure for DIPG 1028 -- 9:...
RNA-seq技术目前网络上针对RNA-seq的教程文章主要以代码流程实战为主,而本文重点聚焦于RNA-seq技术的理论部分,旨在通过对RNA-seq技术的测序原理和分析原理进行全面介绍,使大家在开展RNA-seq代码实战前有充分的…
单细胞RNA-seq(single cell RNA-seq, scRNA-seq)是目前用于细胞类型、细胞状态研究的核心工具,很多实验室也同时围绕scRNA-seq技术建立了多种计算方法并且优化了建库方法,不同方法在如何鉴别分子的细胞来源和文库建立方面有所区别。scRNA-seq技术不断革新、升级的同时,随之产生的高分辨、高通量数据也助力发表了多项研究...
单细胞标签逆转录测序技术 (single-cell-tagged reverse transcription sequencing, STRT-seq)能够在单细胞水平上鉴定TSS位点。这一方法使用生物素标记的模板置换寡核苷酸来合成cDNA,磁珠捕获并在5’端片段化然后测序。CAGE应用到的5ʹ末端标记技术是由日本理化所 (Riken)开发用于在早期功能基因研究中最大化获得全长...
SHARE-Seq定义的细胞类型在染色质与RNA之间广泛一致性 SHARE-seq在包括小鼠皮肤,大脑和肺在内的多种组织的细胞或细胞核中表现良好(图2A–2C)。皮肤富含多种谱系的细胞类型-一些具有高度增殖性,而另一些则处于休眠或缓慢循环-大量的干细胞会产生明确的...
早期的RNA-seq实验从细胞群(如来源于某个组织或器官的细胞)中得到DGE数据,并可以应用于很多物种,如玉米(),拟南芥(),酿酒酵母(),鼠()和人()。虽然RNA-seq这个词通常包含很多不同的RNA相关的方法或生物应用,但DGE分析始终是它的主要应用(表1),并且是DGE研究的常规工具。
单细胞标签逆转录测序技术 (single-cell-tagged reverse transcription sequencing, STRT-seq)能够在单细胞水平上鉴定TSS位点。这一方法使用生物素标记的模板置换寡核苷酸来合成cDNA,磁珠捕获并在5’端片段化然后测序。CAGE应用到的5ʹ末端标记技术是由日本理化所 (Riken)开发用于在早期功能基因研究中最大化获得全长...