搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1237、弹幕量 2、点赞数 46、投硬币枚数 25、收藏人数 147、转发人数 11, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
使用R语言介绍单细胞RNA-Seq数据的差异表达特征及聚类识别 252 -- 21:55 App 介绍数种单细胞数据处理的软件 浏览方式(推荐使用) 哔哩哔哩 你感兴趣的视频都在B站 打开信息网络传播视听节目许可证:0910417 网络文化经营许可证 沪网文【2019】3804-274号 广播电视节目制作经营许可证:(沪)字第01248号 增值电信业务...
为了验证鉴定小鼠interneurons的Dlx1/2调控网络,作者分析了人脑的sNuc-Seq(Single nuclei RNA-Seq)数据集。 在人类脑sNuc-Seq数据集上,SCENIC也鉴定出由DLX1/2强烈驱动的interneurons细胞群,该群具有与小鼠相同的motif,并且识别出一组保守的靶标,包括DLX1本身。 接下来,作者将这种跨物种分析扩展到其他细胞类型。与基...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。 目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...
单细胞RNA测序(scRNA-seq )是一个飞速发展的领域,该技术帮助科研人员从一堆细胞(bulk)水平精细到单细胞(single-cell)水平研究基因的表达状态,从而可以更加精细的刻画科研对象的分子状态(例如细胞图谱,表达特征等)。目前该领域涌现了一大批用于单细胞RNA测序分析的方法,随着越来越多方法的出现,如何选择和组合使用这些方...
2.之后加入的template-switching oligonucleotide(TSO)引物,由于在合成时携带3个RNA碱基G,会同第一链cDNA末端多加的C碱基杂交,顺理成章地将模板转换成第一链cDNA,而不是再使用RNA酶将RNA降解后使cDNA上位为模板。这样,我们就有了双链的cDNA。 可以看到,由于START-seq是要做高通量的单细胞测序,因此,在TSO引物(图...
使用single-cell RNA-seq能够从海量的单细胞数据中揭示组织中不同细胞类型,以及同一细胞中不同基因的表达情况。这篇文章通过单细胞RNA-seq构造了小鼠雄性生殖细胞分化发育的表达动态图谱,揭示了关键调控因子,并且提供了一种分离最后阶段圆形精子的表面标...
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物生物...
首先我们先来回顾一下上一期讲到的Single cell RNA-seq 的原理,首先是2006年末端加A形成第一链cDNA的方法奠定了后来的单细胞转录组测序的问世,2009年,二代测序的发展结合末端加A的思路成就了第一篇单细胞转录组文章,2011年富集5端的带细胞Barcode的模板转换法原理启发了之后一大批单细胞转录组方法的建立。2012年,...
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物生物...