搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1656、弹幕量 2、点赞数 57、投硬币枚数 27、收藏人数 167、转发人数 21, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
介绍为什么要做单细胞rna测序,以及具体如何做, 视频播放量 128、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 5、转发人数 0, 视频作者 小云爱生信, 作者简介 我司将持续更新生物信息学,相关视频,文章,关注可私信提问哦!,相关视频:RNAseq数据中Fastq到count教程,从
为了验证鉴定小鼠interneurons的Dlx1/2调控网络,作者分析了人脑的sNuc-Seq(Single nuclei RNA-Seq)数据集。 在人类脑sNuc-Seq数据集上,SCENIC也鉴定出由DLX1/2强烈驱动的interneurons细胞群,该群具有与小鼠相同的motif,并且识别出一组保守的靶标,包括DLX1本身。 接下来,作者将这种跨物种分析扩展到其他细胞类型。与基...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。 目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...
2.之后加入的template-switching oligonucleotide(TSO)引物,由于在合成时携带3个RNA碱基G,会同第一链cDNA末端多加的C碱基杂交,顺理成章地将模板转换成第一链cDNA,而不是再使用RNA酶将RNA降解后使cDNA上位为模板。这样,我们就有了双链的cDNA。 可以看到,由于START-seq是要做高通量的单细胞测序,因此,在TSO引物(图...
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物生物...
CEL-seq2优化了反转引物的长度,并使用SuperScript II Double-Stranded cDNA Synthesis Kit来进行一链,二链的合成(上一篇推文有同学问到二链合成的问题,这里介绍下,cDNA第二链合成的原理是用RNase H使RNA-DNA杂合链中的RNA产生切口,再用DNA Polymerase I通过切口平移(nick translation)反应进行RNA链取代合成cDNA第二...
如今,单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种成熟可靠的方法,使研究人员能够深入研究由细胞异质性驱动的生物复杂性。使用scRNA-seq技术的科学家已经取得了令人难以置信的发现。 2009年scRNA-seq的出现,就像美国宇航局在20世纪90年代发射哈勃太空望远镜一样,让我们对一个被低估的宇宙有了前所未有的认识。从那时起,从植物生物...
单细胞RNA测序(scRNA-seq )是一个飞速发展的领域,该技术帮助科研人员从一堆细胞(bulk)水平精细到单细胞(single-cell)水平研究基因的表达状态,从而可以更加精细的刻画科研对象的分子状态(例如细胞图谱,表达特征等)。目前该领域涌现了一大批用于单细胞RNA测序分析的方法,随着越来越多方法的出现,如何选择和组合使用这些方...
首先我们先来回顾一下上一期讲到的Single cell RNA-seq 的原理,首先是2006年末端加A形成第一链cDNA的方法奠定了后来的单细胞转录组测序的问世,2009年,二代测序的发展结合末端加A的思路成就了第一篇单细胞转录组文章,2011年富集5端的带细胞Barcode的模板转换法原理启发了之后一大批单细胞转录组方法的建立。2012年,...