结果表明，nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq （m6A-cross- linking-exonuclease sequencing ）结果高度一致，90% xPore鉴定出的显著性m6A位点（top significant 1500 positions）与DRACH motif (D=G/A/U, R=G/A, H=A/U/C，最常见的m6A motif) 或者其他已知m6A位点高度...
我们通过分析RNA-seq数据证明了UAP56和COP1在拟南芥中也调节AS(图5A)。AS基因的热图表明,d3#2和cop1-4突变体中的剪接模式在黑暗和光明中与Col-0相比有很大不同(图5B)。维恩图显示了414和503个AS事件分别在黑暗和红光照射中由UAP56与COP1共同控制(图5 C-D)。热图表示共调节AS事件的基因在uap56和cop1系中...
转录组测序(RNA‐Seq)是研究不同实验组之间基因表达水平变化的有力工具。然而,短读长测序技术由于在建库过程中需要人工的将转录本片段化,导致其在转录组分析中仍然存在诸多问题,比如难以组装出精确的全长转录本、可变剪切识别结果中存在较高的假阳性率、不能进行异构体水平表达定量等。基于Nanopore技术的全长cDNA测序...
Nanopore测序技术可以用来研究RNA修饰和RNA剪接等过程。例如，Nanopore测序技术可以通过直接测量RNA聚合酶在转...
结果表明,nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq(m6A-cross- linking-exonuclease sequencing )结果高度一致,90% xPore鉴定出的显著性m6A位点(top significant 1500 positions)与DRACH motif(D=G/A/U, R=G...
结果表明,nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq(m6A-cross- linking-exonuclease sequencing )结果高度一致,90% xPore鉴定出的显著性m6A位点(top significant 1500 positions)与DRACH motif(D=G/A/U, R=G/A, H=A/U/C,最常见的m6A motif)或者其他已知m6A位点高度重合。为...
我们通过分析RNA-seq数据证明了UAP56和COP1在拟南芥中也调节AS(图5A)。AS基因的热图表明,d3#2和cop1-4突变体中的剪接模式在黑暗和光明中与Col-0相比有很大不同(图5B)。维恩图显示了414和503个AS事件分别在黑暗和红光照射中由UAP56与COP1共同控制(图5 C-D)。热图表示共调节AS事件的基因在uap56和cop1系中...
因此,本研究使用大豆(Glycine max)-普通豆(Phaseolus vulgaris)嫁接植物系统,利用sRNA测序、Illumina短读长测序、Nanopore长读长测序技术系统地探究了sRNA与mRNA在远距离植物组织之间移动的调控机制的不同。 原文链接:https://www.nature.com/articles/s41477-020-00829-2...
Benagen 对 RNA-Seq 基因差异表达输出结果的统计软件 Benagen lncRNA and mRNA identification 软件 Benagen Gene ontology 功能分类及绘图软件 高新技术企业证书 贝纳基因ONT实验室最新认证 一种微生物多重PCR靶向扩增引物池的设计方法 一种用于检测血流感染病原的引物组合及其应用_00 一种基于高通量测序动...
[2]Froussios K , Kira Mourão, Simpson G , et al. Relative Abundance of Trans ( RATs ): Identifying differential isoform abundance from RNA-seq[J]. F1000 Research, 2019, 8:213. 新品推荐: 上新品 | 百迈客HS(热启动)高保真酶全新上市...