结果表明，nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq （m6A-cross- linking-exonuclease sequencing ）结果高度一致，90% xPore鉴定出的显著性m6A位点（top significant 1500 positions）与DRACH motif (D=G/A/U, R=G/A, H=A/U/C，最常见的m6A motif) 或者其他已知m6A位点高度...
转录组测序(RNA‐Seq)是研究不同实验组之间基因表达水平变化的有力工具。然而,短读长测序技术由于在建库过程中需要人工的将转录本片段化,导致其在转录组分析中仍然存在诸多问题,比如难以组装出精确的全长转录本、可变剪切识别结果中存在较高的假阳性率、不能进行异构体水平表达定量等。基于Nanopore技术的全长cDNA测序...
普通RNA-seq需要考虑建库过程中的artifect而Nanopore可以直接检测到antisense transcripts 普通RNA-seq需要在合成cDNA的基础上进行PCR扩增建库而Nanopore直接对RNA进行阅读,所以可以保留splice junction,RNA修饰等信息 Nanopore可以阅读long-read RNA Nanopore不需要enzymatic synthesis reaction 2. RNA修饰是什么 RNA修饰指的是...
Benagen 对 RNA-Seq 基因差异表达输出结果的统计软件 Benagen lncRNA and mRNA identification 软件 Benagen Gene ontology 功能分类及绘图软件 高新技术企业证书 贝纳基因ONT实验室最新认证 一种微生物多重PCR靶向扩增引物池的设计方法 一种用于检测血流感染病原的引物组合及其应用_00 一种基于高通量测序动...
图4由UAP56和COP1共同调节的RNA-seq UAP56和COP1控制mRNA的选择性剪接 我们通过分析RNA-seq数据证明了UAP56和COP1在拟南芥中也调节AS(图5A)。AS基因的热图表明,d3#2和cop1-4突变体中的剪接模式在黑暗和光明中与Col-0相比有很大不同(图5B)。维恩图显示了414和503个AS事件分别在黑暗和红光照射中由UAP56与...
结果表明,nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq(m6A-cross- linking-exonuclease sequencing )结果高度一致,90% xPore鉴定出的显著性m6A位点(top significant 1500 positions)与DRACH motif(D=G/A/U, R=G/A, H=A/U/C,最常见的m6A motif)或者其他已知m6A位点高度重合。为...
Nanopore long-read rnaseq reveals widespread transcriptional variation among the surface. Issue: NATURE COMMUNICATIONS, 8 (2017).Byrne A, Beaudin AE, Olsen HE, Jain M, Cole C, Palmer T, DuBois RM, Forsberg EC, Akeson M, Vollmers C. 2017. Nanopore long-read RNAseq reveals widespread ...
全长转录组,又称为Isoform Sequencing(Iso-Seq),无需打断,基于三代测序平台直接获取转录本的5ˊ到3ˊ高质量全长序列,可准确识别可变剪接、基因融合、可选择性多聚腺苷酸化APA、等位基因特异性表达等转录本结构方面变异。基于Nanopore三代测序平台进行全长转录组测序,除了可准确鉴别上述转录本结构变异,还可实现转录本...
结果表明,nanopore direct RNA-seq/xPore鉴定的m6A位点与基于二代测序的m6ACE-seq(m6A-cross- linking-exonuclease sequencing )结果高度一致,90% xPore鉴定出的显著性m6A位点(top significant 1500 positions)与DRACH motif(D=G/A/U, R=G...
预览播放中,打开优酷APP看高清完整版 【陈巍翻译】Nanopore测序原理 +追 超清画质 2 收藏 下载 分享 选集 33:44 【陈巍学基因】视频 132:深度解读 2024 年诺贝生理学奖——发现并确认 microRNA 的调控作用 2024-10-28 29:22 【陈巍学基因】视频 131:Bridge RNA 桥接 RNA 做基因编辑 2024-09-23 28:14 【...