它们也具有已证明的功能，==反式作用调节RNA来源于传统上作为mRNA 3'未翻译区域的序列==。
预测肝硬化患者肝癌发生的候选lncRNA-miRNA-mRNA网络:综合生物信息学分析 摘要 目的：本研究通过生物信息学分析，探索潜在的竞争性内源性RNA (ceRNA)网络在肝硬化患者HCC发展中的作用。方法：利用GEO和TCGA数据库的数据挖掘，挖掘mRNA、lncRNA和miRNA差异表达谱。在匹配的HCC队列中，RT-PCR证实了他们的表达(n = 6/...
根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR数据库中获得。结果发现只有15个有显着差异表达(表2)。在上述miRNA的基础上,利用StarBase和LncBase获得了106个常见的lncRNA-miRNA调控对(图7A)。与GEPIA的表达...
研究人员比较公共TCGA和GEO数据库中可用的RNA测序数据,以确定在HCC和正常组织中不同水平表达的mRNA、lncRNA和circRNA,并预测差异表达(DE)circRNA和lncRNA的靶向miRNA,以构建HCC的预后circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络。他们建立了一个七基因的HCC标记,并验证了预后标记中的一个中枢基因DTYMK,作为一种新的潜在生物...
piRNA是一类新发现的,长度为26-31nt的小RNA分子,通常通过与Argonaute蛋白(如:PIWIL 蛋白亚族)的结合来发挥沉默基因和调控生殖细胞基因组稳定性等作用。piRNA可以与lncRNA通过互补配对的方式结合,其中lncRNAs起到的主要生物学作用包括基因调控激活和抑制。本研究通过聚焦于piR-30188与lncRNA OIP5-AS1的互作调控网络来...
TA的最新馆藏 【R】富集分析常见的OrgDB包对应的物种 【R语言】HPAanalyze下载HPA免疫组化图 miRNA-circRNA-mRNAceRNA网络构建(一) miRNA-lncRNA-mRNA ceRNA网络分享(二) 【R语言】多序列比对及可视化 【R语言】为啥读进来的文件少了几行??? 喜欢该文的人也喜欢 更多 热门阅读 换一换 ...
为探究牦牛心脏缺氧适应机制,研究人员分析了牦牛心脏冠状动脉血管平滑肌细胞(CASMCs)在缺氧和常氧下的 lncRNA - miRNA - mRNA ceRNA 网络,发现相关差异表达基因及通路,为理解牦牛缺氧适应分子机制提供依据。 牦牛心脏缺氧适应机制研究:开启高原生命奥秘之门
表达mRNA 20个,lncRNA 79个,miRNA 29个.在对CAG脾虚证相关的差异基因的功能分析中发现,细胞质膜和细胞质膜的组成成分在差异表达mRNA和miRNA的GO分析中均显著富集.通过对CAG脾虚证的差异表达miRNA,mRNA和lncRNA进行ceRNA分析,共获得1028个miRNA-lncRNA对,1123个miRNA-mRNA对,最终筛选到3625对ceRNA.这些ceRNA调控网络...
网络.因此,近些年,lnc RNA,mi RNA和m RNA之间的相互调控作用成为生物信息研究的热点之一.随着调控网络研究的发展,发现lnc RNA可以以一种竞争性内源性RNA(Competing Endogenous RNA,ce RNA)参与靶mi RNA的表达调控.同时,mi RNA能够靶向m RNA的3'UTR,抑制m RNA的翻译或者降解m RNA.总之,在预测lnc RNA,mi RNA,...
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...