并且rRNAs、tRNAs和snoRNAs经过处理生成小的调控RNA，包括miRNA 11 - 14，在某些情况下有助于跨代表观...
1.DEGs、DEMs和DELs的鉴定（DEGs：差异表达的基因，DELs：差异表达的长非编码RNA，DEMs：差异表达的microRNAs，lncRNA：长非编码RNA，miRNA：microRNA，mRNA：messager RNA）→以火山图或热图呈现。2. 功能富集分析：了解相关的DEGs的功能。3. PPI（protein-protein interaction）网络的建立及枢纽基因的鉴定。4. lncRN...
③这里我们演示miRNA-mRNA interactions的示例数据库优化: Starbase可查询miRNA、LncRNA、mRNA相互调控和结合的预测,存储了大量的互作网络结合的miRNA,ceRNA的竞争结合,RNA蛋白结合等数据二、LncRNA与miRNA结合预测 长链非编码RNA(Long-noncodingRNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200bp的非编码RNA,可作为人类基因组中一类重...
4、miRNA、lncRNA、circRNA的鉴定以及ceRNA网络的构建 通过搜索miRDB、miRWalk和TargetScan数据库,共预测出与上述8个关键基因相关的199个重叠的上游miRNA(图6A)。根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR...
筛选了与干旱抗性相关的lncRNA、miRNA和mRNA，构建了cerNA网络。通过基因本体论(GO)富集和京都基因和基因...
7622 -- 36:53 App 【非编码RNA系列】非编码RNA基础——lncRNA 4806 1 11:05 App 【WB实验】western blotting检测信号通路操作流程,解说+演示 1264 -- 10:32 App 明显信号通路的调节机制 1973 -- 7:21 App 以关键分子命名的通路通常具有百搭属性,需要重点关注 1.2万 13 13:33 App 【转录调控】EMSA...
由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel...
长链非编码RNA(Longnoncoding RNA)是一类长度大于200nt,不编码蛋白质的RNA。LncRNA的功能多样,如图1所示,A:充当蛋白质和染色质的连接因子,引起染色质重构(chromatin remodeling);B:充当miRNA海绵;C:充当“scaffold”脚手架;D:与转录因子结合,引起转录激活;E:把转录因子拉走,引起转录抑制;FGH:与mRNA结合抑制翻译、...
microRNA(miRNA):长度22nt左右,是内源性非编码小RNA。其实除了mRNA,基本上其它RNA都是非编码RNA,不能决定蛋白的氨基酸序列。miRNA的功能主要是调控RNA的转录,通过结合mRNA导致基因沉默,即可以导致靶基因表达下调。 lncRNA:长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调...
miRNA是一个十分巨大的非编码小分子RNA家族,在人类细胞中已鉴定了千余种miRNA,调控超过30%的基因表达。 在真核细胞生物中miRNA构成高度复杂的调控网络,控制蛋白质表达谱,进而决定各类细胞的功能及命运。另一方面,miRNA与各种疾病有关,在人类肿瘤中发现大量miRNA表达异常,因此,miRNA表达谱可以作为肿瘤等疾病临床诊断、...