然而，后来发现，虽然一些miRNA是由premRNAs8的内含子生成的，但是miRNA和snoRNAs的非编码初级转录本也可...
1.DEGs、DEMs和DELs的鉴定（DEGs：差异表达的基因，DELs：差异表达的长非编码RNA，DEMs：差异表达的microRNAs，lncRNA：长非编码RNA，miRNA：microRNA，mRNA：messager RNA）→以火山图或热图呈现。2. 功能富集分析：了解相关的DEGs的功能。3. PPI（protein-protein interaction）网络的建立及枢纽基因的鉴定。4. lncRN...
4、miRNA、lncRNA、circRNA的鉴定以及ceRNA网络的构建 通过搜索miRDB、miRWalk和TargetScan数据库,共预测出与上述8个关键基因相关的199个重叠的上游miRNA(图6A)。根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR...
3、采用R 语言的limma-voom工具分析H19高低表达组,鉴定出上调和下调的miRNA,TF,gene; 4、提出了两种情况来解释不同条件下三联体中每对参与的两个生物分子之间的调控: (1)H19(↓)—UPRmiRH19low(↑)—DWRTFH19low/DWRGeneH19low(↓):H19表达下调导致其靶miRNA表达上调,从而导致其靶TFs或基因表达下调; (2...
通过利用lncRNA、miRNA和mRNA数据形成的cerNA网络，我们在转录水平上对基因间表达的调控机制有了更清晰的...
上一个: GO/Pathway富集分析 下一个: 调控网络图构建服务服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图...
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non-coding RNA，lncRNA）是对应短⽚段⾮编码RNA(miRNA, piRNA, snoRNA, shRNA, etc.)的⼀个较⼤的集合概念，是较⾼级真核⽣物（其实也没多⾼级，昆⾍也有）细胞转录组中长度超过200nt，且不编码蛋⽩翻译的线性RNA，包括pseudogene和long intergenic non-coding RNA(lincRNA)等，它们与mRNA相...
circRNAs具有类似于lncRNAs的性质,参与转录和翻译调控,并能作为“miRNA-sponges”发挥功能。 miRNA通过结合3‘-UTR的种子区(seed region)下调靶基因mRNA在胞质内的表达是其经典生物学功能,也是内源竞争性(competing endogenous) RNA分子网络的理论基础。 Cdr1as与miRNA互作的研究过程 ...
由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel...