而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。 ceRNA调控基因表达的机制图 通...
而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。 ceRNA调控基因表达的机制图 通...
另外,该数据库支持上传个人数据,仅考虑人类血液外泌体来源的circRNA,lncRNA和mRNA数据,并要求提取的血液外泌体满足ISEV(国际细胞外囊泡协会)最低要求。 二、数据库功能及操作演示 1. 信息浏览:Browse 首先,外泌体cirRNA信息浏览,可从主页点击进入,或点击Browse目录下cirRNA进入,以检索肝癌患者血液外泌体中表达上调...
lncRNA能够与miRNA反应元件（MREs）结合，从而调节mRNA的水平。当lncRNA表达沉默时，mRNA会受到miRNA介导的沉默复合体（RISC）作用而被降解；反之，当lncRNA表达激活后，它能够竞争性结合RISC复合物，降低miRNA的抑制功能，从而上调靶基因的表达量。这一机制在lncRNA研究中扮演着重要角色。其次，lncRNA与DNA...
该数据库目前共收录92例血液样本,58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA数据。点击Sample,可见其中包括健康对照者32例、冠状动脉心脏疾病患者6例、结直肠癌12例、肝细胞癌21例、胰腺腺癌14例、乳腺癌2例和全血样本5例。 点击FAQ,下拉至第7项可见该数据库整合的RNA-seq数据集,可通过GSE号在GEO数据库检索,或...
需要准备两个文件,一个miRNA序列种子文件和lncRNA UTR序列文件。文件格式如下: #miRNA文件格式 miR_9606_info.txt #MiRBase ID Seed+m8 Species ID hsa-miR-9500 AGGGAAG 9606 hsa-miR-8485 ACACACA 9606 hsa-miR-8088 CUCGGUA 9606 hsa-miR-8087 AAGACUU 9606 hsa-miR-8086 GCUAGUC 9606 hsa-miR-8084...
而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。
miRNA、lncRNA 和 circRNA 已成为研究的大热门,也是近年来国自然申请标书中的香饽饽。这两个非编码RNA家族的重要成员以多种方式调节生命活动,包括转录调节、转录后调节、翻译调节、
大家都知道,RNA世界有三宝:miRNA、lncRNA和circRNA。无论是其中哪一个,均有众多的科研者对其进行孜孜不断的探索与追求。老实说,这世上原本没有套路,只不过做的人多了,套路也就应运而生了。而lncRNA红火了这么些年,套路也是层出不穷,但其中最为经典的也无外乎以下几种套路。