而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。 ceRNA调控基因表达的机制图 通...
而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功能,上调靶基因的表达量。 ceRNA调控基因表达的机制图 通...
另外,该数据库支持上传个人数据,仅考虑人类血液外泌体来源的circRNA,lncRNA和mRNA数据,并要求提取的血液外泌体满足ISEV(国际细胞外囊泡协会)最低要求。 二、数据库功能及操作演示 1. 信息浏览:Browse 首先,外泌体cirRNA信息浏览,可从主页点击进入,或点击Browse目录下cirRNA进入,以检索肝癌患者血液外泌体中表达上调...
lncRNA能够与miRNA反应元件(MREs)结合,从而调节mRNA的水平。当lncRNA表达沉默时,mRNA会受到miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用而被降解;反之,当lncRNA表达激活后,它能够竞争性结合RISC复合物,降低miRNA的抑制功能,从而上调靶基因的表达量。这一机制在lncRNA研究中扮演着重要角色。其次,lncRNA与DNA...
该数据库目前共收录92例血液样本,58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA数据。点击Sample,可见其中包括健康对照者32例、冠状动脉心脏疾病患者6例、结直肠癌12例、肝细胞癌21例、胰腺腺癌14例、乳腺癌2例和全血样本5例。 点击FAQ,下拉至第7项可见该数据库整合的RNA-seq数据集,可通过GSE号在GEO数据库检索,或...
targetScan 需要准备两个文件,一个miRNA序列种子文件和lncRNA UTR序列文件。文件格式如下: 脚本可从targetScan[http://www.targ...
miRNA、lncRNA 和 circRNA 已成为研究的大热门,也是近年来国自然申请标书中的香饽饽。这两个非编码RNA家族的重要成员以多种方式调节生命活动,包括转录调节、转录后调节、翻译调节、
作为ncRNA的明星分子,miRNA虽然研究近30年,与lncRNA、circRNA相比,关注度貌似开始下降,实则近四年相关的国自然年度中标数仍远超circRNA。若转换思路,结合外泌体等其他热点,也会使miRNA研究达到老树开新花的新境界。lncRN 链接 发布于 2022-05-13 10:33 ...
前面两期为大家详细介绍了非编码RNA中的#lncRNA和#circRNA,本期继续为大家介绍一种非编码RNA:miRNA。本文将从miRNA的发现、结构、作用机制、功能、表达调控以及常用数据库几个方面为大家详细介绍#非编码RNA调控系列之#miRNA的调控。 #汉恒生物 #科研 +5