❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞ 转录组测序简介 「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等)...
老实说,lncRNA和circRNA原本同属一宗,只不过circRNA因独特的环状结构以及数量庞大的基数,才独立出来自成一派。显然,lncRNA与circRNA的相关研究是有共通之处。既然circRNA已然跨界领跑蛋白编码,那么lncRNA又岂能屈居人后呢?很快,lncRNA点亮了新技能,以短ORF编码特定多肽,誓要在蛋白编码领域分一杯羹。 至于lncRNA到底能...
老实说,lncRNA和circRNA原本同属一宗,只不过circRNA因独特的环状结构以及数量庞大的基数,才独立出来自成一派。显然,lncRNA与circRNA的相关研究是有共通之处。既然circRNA已然跨界领跑蛋白编码,那么lncRNA又岂能屈居人后呢?很快,lncRNA点亮了新技能,以短ORF编码特定多肽,誓要在蛋白编码领域分一杯羹。 至于lncRNA到底能...
关于miRNA,lncRNA,circRNA研究方法 miRNA, lncRNA, circRNA都是RNA,它们的区别在于miRNA是微小RNA,长度较短,约20~25个核苷酸;lncRNA是长链非编码RNA,长度较长,长度一般大于200核苷酸,circRNA是环状RNA,一般呈环状存在。 对于miRNA和lncRNA来说,它们的长度不同决定了针对它们研究的难易程度不同。另外,现有的针对三种...
lncRNA功能的交互式开放平台 lncRNA常用的研究策略,你造吗? circRNA 1、背景介绍 环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),主要由前体RNA(pre-mRNA)通过可变剪切加工产生,circRNA 广泛存...
miRNA、LncRNA、CircRNA互相作用 LncRNA vs. miRNA 什么是lncRNA和miRNA,他们都来自一个大家庭:非编码RNA(non-coding RNA)。 先说微小RNA(micro RNA, miRNA),MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单...
lncRNA功能的交互式开放平台 lncRNA常用的研究策略,你造吗? circRNA 1、背景介绍 环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),主要由前体RNA(pre-mRNA)通过可变剪切加工产生,circRNA 广泛存在于所有真核生物中,并且非常稳定。目前,circRNA 的研究已经成为了RNA 研究...
(2)circRNA参与ceRNA的分析 10:40~12:00 ceRNA分析 ceRNA(竞争性内源RNA)的机制 ceRNA关系对分析 ceRNA网络构建 13:30~15:00 功能富集分析 lncRNA-mRNA共表达分析 miRNA功能分析(GO和pathway富集) lncRNA功能分析(GO和pathway富集) circRNA功能分析(GO和pathway富集) ...
lncRNA常用的研究策略,你造吗? circRNA 1、背景介绍 环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),主要由前体RNA(pre-mRNA)通过可变剪切加工产生,circRNA 广泛存在于所有真核生物中,并且非常稳定。目前,circRNA 的研究已经成为了RNA 研究领域的新热点,研究发现circRNA...
最近,ncRNA的世界里百花齐放,miRNA、lncRNA、circRNA三个“大腕”轮番上阵,真真是你方唱罢我登场,让人感到眼花缭乱、应接不暇。ncRNA的故事个个精彩纷呈,好评如潮,晋升为科研界的大IP。可是故事中的角色太多,让绝大多数“脸盲”的科研者头疼不已。为了增加各位“大腕”的辨识度,今天就和大家聊一聊ncRNA命名的那些...