lncRNA与microRNA互作概述 lncRNA (Long non-coding RNA)即长链非编码RNA,通常长度在200-100000 nt,具有5’帽子和3’polyA尾巴结构。 lncRNAs作用范围广泛,机制非常复杂,可以与DNA、RNA、蛋白质互作,参与表观、转录、转录后等多个层面的调控,在生命活动中有重要作用。lncRNA与miRNA的结合是其重要的调控方式之一,...
验证PAARH和HOTTIP分别与六种miRNA的结合。以上结果显示,miRNA转染组的荧光活性显著降低,表明miRNA与PAARH和HOTTIP之间存在靶向结合。 注意该研究中没有突变型的结果,这样的例子很少,一般荧光素酶的结果是需要包括突变型和野生型的,自己设计实验的时候注意一下。 (3)结果描述 这个结果描述比较简单,写作还是建议还是参考...
lncRNA,miRNA,mRNA互作 通过lncRNA获得结合的miRNA（3个miRNA预测数据库中都存在），再获得miRNA作⽤的靶基因mRNA，靶基因mRNA与任⼀肿瘤差异mRNA取交集，交集mRNA与其相关miRNA,lncRNA作互作图，并将交集mRNA作GO和KEGG富集分析。通过lncRNA获得结合的miRNA 1.lncRNA与miRNA的区别 2.mircode数据库 3.这可能是最...
通过lncRNA获得结合的miRNA(3个miRNA预测数据库中都存在),再获得miRNA作用的靶基因mRNA,靶基因mRNA与任一肿瘤差异mRNA取交集,交集mRNA与其相关miRNA,lncRNA作互作图,并将交集mRNA作GO和KEGG富集分析。 通过lncRNA获得结合的miRNA 1.lncRNA与miRNA的区别 2.mircode数据库 3.这可能是最轻松易懂的lncRNA与miRNA介绍了...
GCSC中的lncRNA-miRNA互作的相对富集。 双荧光素酶报告基因检测GCSC中潜在的miRNA-lncRNA互作。 miR-411-3p和miR-24-3p在GCSCs和GCNSCs中的表达谱。 使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。
GCSC中的lncRNA-miRNA互作的相对富集。 双荧光素酶报告基因检测GCSC中潜在的miRNA-lncRNA互作。 miR-411-3p和miR-24-3p在GCSCs和GCNSCs中的表达谱。 使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。
1、根据之前的研究筛选了胃癌组织中显著下调表达的miR-551b-3p作为研究对象,从miRNA和lncRNA之间的相互调控方式出发探索其中的分子机制。 2、生物信息学预测方法协助筛选miRNA的靶向lncRNA和mRNA,在海量数据中锁定候选者,有助于高效地找寻靶基因。 3、数据丰富,文章分别从表型数据(细胞增殖、程序性死亡等)、生物信息...
结肠直肠癌和肝细胞癌细胞系中敲低Cdr1as,通过增加miR-7水平减弱了癌症增殖过程。 Rajewsky等人设计了完全删除circRNA转录本的Cdr1as KO小鼠模型,在该模型上通过改良的CLIP分析验证Cdr1as与miR-7and miR-671 直接互作并可以对其AGO2结合的RNA靶位点进行测序。四个脑区域的mi...
GCSC中的lncRNA-miRNA互作的相对富集。 双荧光素酶报告基因检测GCSC中潜在的miRNA-lncRNA互作。 miR-411-3p和miR-24-3p在GCSCs和GCNSCs中的表达谱。 使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。
1.转录组分析后发现,心脏的mRNA和lncRNA中分别有37%和71%比例的来自线粒体DNA。而miRNA则不同,所有miRNA都来自非线粒体。 2.根据表达水平,作者们把转录分为3类,以mRNA转录为例,高表达(RPKM>3)的比例为40%;中等表达(RPKM,1-3)比例为18%;低表达(RPKM<1)比例为42%。同样,在lncRNA和miRNA也发现转录本中...