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lncrnamirna肿瘤宫颈癌相互作用发生 肿瘤发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用 肿瘤是一种复杂的疾病,其发生和发展涉及到许多基因的异常表达。 近年来,越来越多的研究表明,microRNA(miRNA)和长链非编码RNA (lncRNA)在肿瘤发生过程中起着至关重要的作用。本文将探讨肿瘤 发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用,以期为肿瘤治...
通过整合lncRNA与miRNA的不同相似性信息构建的lncRNA相似度矩阵以及miRNA相似度矩阵网络;使用二阶图卷积神经网络学习相似矩阵信息的二阶表示,同时将采用不同的图嵌入方法将得到的多种特征表示与二阶图表示进行特征融合,通过多层感知机(MLP)获取内部表示,将lncRNA与miRNA的特征向量信息通过内积融合得到评分预测矩阵,最后...
miRNA与LncRNA相互作用在骨关节炎中的作用
实验证据支持的相互作用数据,主要是从文献中整理得到的结果,包括了qPCR, northern blot, reporter assay, CLIP-seq等检测方法,软件预测是通过DIANA-microT这个软件来实现的。其中软件预测的lncRNA与miRNA相互作用数据是可以免费下载的,实验证据支持的数据需要向开发团队申请才可以。
通过合并共表达获得总共14对ceRNA对和lncRNA–miRNA–mRNA靶向对,其中ceRNA对涉及6个上调的lncRNA和8个下调的lncRNA。详细的预测过程如图4所示,并且使用Cytoscape软件可视化ceRNA调控网络。其中,我们发现dre-miR-24b-3p和dre-miR-193b-3p是ceRNA对的核心元件,与四个lncRNA和三个mRNA相互作用,包括LNC_007210,LNC_011...
通过这个数据库,我们可以查询到lncRNA与miRNA之间的相互作用信息,但是在线检索一次只能检索几个lncRNA或者miRNA, 同时需要注意lncRNA id的格式,只支持refseq Id,ensembl id和human body map项目中给出的lncRNA id。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—...
lncRNA与miRNA相互作用对疾病的影响.pdf,2016年2月 基础医学与临床 Febman,2016 第36卷第2期 BasicClinicalMedicine Voi.36No.2 文章编号:1001—6325{2016)02—0267—05 短篇综述 lncRNA与miRNA相互作用对疾病的影响 易红,张政+ (重庆医科大学细胞生物学及遗传学教研
lncRNA与miRNA 相互作用预测研究丁尉哲 1 ,南洋1 ,吴卷书 1 ,崔迪1 ,张力1,2,3 ,刘宏生 1,2,3(1.辽宁大学生命科学院;2.辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心;3.辽宁省药物分子模拟与设计工程实验室,辽宁 沈阳 110036) 摘要: 目的 提出一种基于网络相似性算法的 lncRNA-miRNA 相互作用...