❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞ 转录组测序简介 「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等)...
不幸的是，lncRNA之所以被命名，是因为它们不是lncRNA，而不是它们是lncRNA。这种松散的描述源于这样一...
今天给大家介绍一种新型荧光原位杂交方法:π-FISH rainbow,该技术突破了现有技术壁垒,克服了传统FISH检测的缺陷和不足,能够精准检测到不同物种(动物、植物和病原微生物等)中各种类型RNA(mRNA 、lncRNA、miRNA等),具有杂交效率高、信号放大能力强、背景噪音低、特异性好、检测通量高、应用范围广等优势。 该方法具备...
microRNA(miRNA):长度22nt左右,是内源性非编码小RNA。其实除了mRNA,基本上其它RNA都是非编码RNA,不能决定蛋白的氨基酸序列。miRNA的功能主要是调控RNA的转录,通过结合mRNA导致基因沉默,即可以导致靶基因表达下调。 lncRNA:长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调...
③这里我们演示miRNA-mRNA interactions的示例数据库优化: Starbase可查询miRNA、LncRNA、mRNA相互调控和结合的预测,存储了大量的互作网络结合的miRNA,ceRNA的竞争结合,RNA蛋白结合等数据二、LncRNA与miRNA结合预测 长链非编码RNA(Long-noncodingRNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200bp的非编码RNA,可作为人类基因组中一类重...
7.1 敲降和过表达lncRNA-APF会降低/增加ATG7的表达。(lncRNA可以调控mRNA) 7.2 过表达miR-188-3p会导致ATG7表达下调;但同时过表达APF的话(且APF的表达大于miR-188-3p),ATG7的表达增加了,这些结果可以推测这个结论:APF表达增高,会竞争性结合miR-188-3p,导致miR-188-3p不能作用下游基因ATG7。(这只是个推论) ...
lncRNA,miRNA,mRNA互作 通过lncRNA获得结合的miRNA（3个miRNA预测数据库中都存在），再获得miRNA作⽤的靶基因mRNA，靶基因mRNA与任⼀肿瘤差异mRNA取交集，交集mRNA与其相关miRNA,lncRNA作互作图，并将交集mRNA作GO和KEGG富集分析。通过lncRNA获得结合的miRNA 1.lncRNA与miRNA的区别 2.mircode数据库 3.这可能是最...
7622 -- 36:53 App 【非编码RNA系列】非编码RNA基础——lncRNA 4806 1 11:05 App 【WB实验】western blotting检测信号通路操作流程,解说+演示 1264 -- 10:32 App 明显信号通路的调节机制 1973 -- 7:21 App 以关键分子命名的通路通常具有百搭属性,需要重点关注 1.2万 13 13:33 App 【转录调控】EMSA...
通过lncRNA获得结合的miRNA(3个miRNA预测数据库中都存在),再获得miRNA作用的靶基因mRNA,靶基因mRNA与任一肿瘤差异mRNA取交集,交集mRNA与其相关miRNA,lncRNA作互作图,并将交集mRNA作GO和KEGG富集分析。 通过lncRNA获得结合的miRNA 1.lncRNA与miRNA的区别
7、通过体内移植瘤实验验证lncRNAHOTAIR/miR-20a-5p/HMGA2轴可调节移植瘤的生长。 本文由舍为斯生物刘博提供,希望能为您的科研提供一些帮助,文章中涉及到的qPCR及WB在组织及细胞表达水平,肿瘤细胞培养以及肿瘤细胞功能实验(细胞增殖,迁移,侵袭,凋亡),miRNA与靶基因的结合预测以及双荧光素酶实验进行验证,以及裸鼠成瘤...