该研究采用单细胞RNA测序和ATAC测序技术,对42个和39个人类癌症细胞系进行了细致分析,揭示了显著的转录组和表观遗传异质性。通过单细胞RNA测序,在单细胞层面揭示了不同细胞系中的转录活动差异,发现这些差异主要由多个共同的转录程序驱动。ATAC测序进一步揭示了细胞内基因可访问性和表观遗传调控机制。此外,研究还探讨了拷...
研究团队使用RNA-seq和ATAC-seq数据构造了转录调控网络,该网络中不同聚类的基因之间表现出顺序的调控关系;从中鉴定了446个核心转录因子,并推测它们可能与小麦遗传转化效率的品种间差异有关;通过对比小麦
单细胞 ATAC+RNA 测序 伯豪生物单细胞多组学 ATAC+RNA 联合检测服务,是基于 10X Genomics 平台,对数千个细胞中的每一细胞内的 RNA 和染色质可及性同时检测的新技术。通过这项技术能够测定调控区域对基因表达的影响,从而在目标细胞内实现信息的关联;根据两种分子信息可以更深入地表征复杂的细胞群,捕获细胞异质性,发现...
寻因生物研发团队多年的艰苦攻关,投入了大量的人力、物力,成功将SeekOne DD 单细胞 ATAC + RNA 多组学技术推向市场。SeekOne DD 单细胞ATAC+RNA多组学技术,基于先进的微流控技术原理,实现了单细胞层面基因表达与染色质可及性的同步分析。该技术利用Barcoded Beads进行单细胞的高效分离与精确标记,通过独特的两组引物...
为解决细胞类型注释准确性问题,伦敦帝国理工学院的研究人员开展结合单细胞 ATAC 和 RNA 测序进行监督式细胞注释的研究,发现结合两种测序数据可提升 PBMC 数据注释质量,对神经元细胞无此效果,为单细胞研究提供重要参考。 在生命科学的微观世界里,细胞就像一个个神秘的 “小宇宙”,各自有着独特的 “身份” 和功能。单...
在发表于nature的文章Spatial multi-omic map of human myocardial infarction中,关于单细胞RNA和ATAC的分析是这样的。 组学数据一开始分开整合分析,snRNA的注释结果来辅助注释ATAC数据。 但是在细分某个细胞类型的时候,却是RNA 与ATAC数据直接联合分析(展示在一张UMAP图上), 心肌细胞分亚群 心肌细胞调控 UMAP of sub...
单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序是两种常用的方法,它们分别可以揭示细胞的基因表达和染色质可及性。然而,这两种技术各自存在一些限制。为了克服这些限制并获得更全面的细胞信息,研究人员开发了一种新的技术,称为单细胞RNA-ATAC测序技术。 单细胞RNA-ATAC测序技术结合了单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的优势,可以同时获得...
2025年3月25日,寻因生物举办了一场关于单细胞转录组 + ATAC技术的直播盛会,重磅发布了新品——SeekOne® DD 单细胞 ATAC + RNA多组学解决方案,并深入探讨了其在生命科学前沿领域的广泛应用。 一、技术亮点:独树一帜、突破瓶颈 1、一胞双组,精准高效 ...
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