为验证该猜测,进行了Bulk RNA条形码测序(BRB-seq)[3]。 对经干性抑制剂单药或联合治疗后的EO771荷瘤组织进行取样,并采用BRB-seq平台开展RNA测序分析 (Alithea Genomics, v.0.1.61, cat. no. 10813)。每个样本使用大约50 ng的总...
双端测序模式。按照测序仪要求稀释文库，一般浓度为 2nM，不同样本通过 index 区分，混合后保证各样本比例一致，之后就能上机测序了。总之，RNA-seq 前处理的每个环节都很关键，实验过程中要严格遵守操作规范，详细记录实验数据。一旦发现样本质量不达标，不要勉强使用，重新处理才能保证后续测序和分析顺利进行。
总而言之,研究证明了 smRandom-seq2 是一种用于研究单个微生物转录活性的新型测序技术,可以深入了解人类肠道微生物组中细菌和噬菌体之间的功能异质性和相互作用。 该研究开发了一种针对复杂微生物群落的基于液滴的高通量和高灵敏度 smRNA-...
RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
为了能够评估大量临床冷冻样本,减少解离的批次,研究人员建立了snHH-seq,一个基于液滴的高通量、高灵敏度的单核总RNA测序平台。snHH-seq是一种结合随机RT引物和预索引策略优势的强大方法。snHH-seq具有高通量和高灵敏度,为肿瘤图谱绘制和其他基因组研究提供了新的可能性。
单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法自2005年创立以来,已广泛应用于真核生物领域。目前流行的基于液滴的scRNA-seq系统(如10× Genomics Chromium平台)的关键策略是利用液滴微流控技术将单细胞与唯一的DNA条形编码珠子共同封装在液滴中,随后由珠子上数十亿份唯一的条形编码poly(T)引物捕获多聚腺苷酸化的mRNA。
关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应...
2.3 对于全长转录组测序样品(ISO-seq),请提供浓度大于200 ng/ul,总量大于5 μg的总RNA样品。样品请去蛋白并进行 DNase 处理;全长转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280 为 2.0~2.2,2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥8.5; ...
首先在透化细胞内进行一轮全转录组预索引,然后进行液滴过载的 scRNA-seq,可以显著提高现有微流体液滴的产量。作者将该条形码方法称为“单细胞组合流体索引”(scifi)。在 scifi-RNA-seq中,细胞或细胞核被透化,它们的转录组通过“分裂池”中的逆转录带上预索引条形码标记(round1),然后通过高度过载标准微流体液滴...