RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性:高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计,例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外,该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合,如ChIP-seq、甲基化测序等,从而进一步扩展了其应用范围。
每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基因是活跃的,以及转录了多少。我们可以使用RNA-Seq去检测正常细胞和突变的细胞中的基因表达。然后我们就可以比较这两种细胞类型,在突变细胞中找出它们的不同之处。 image-20201231152706135.pn...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学,由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平(GEL)的测量,GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用,但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
近日,浙江大学郭国骥、梁廷波等研究人员在权威期刊《Advanced Science》上发表了题为“Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq”的研究论文,本研究中,研究人员开发了一种高通量、高灵敏度的方法snHH-seq,该方法将随机引物与液滴微流控平台的预索引策略相结合。这种创新的方法允许从临床冷冻样...
➢高通量RNA-Seq技术应用及前景 第一代测序技术 1954年,首次利用多聚核糖核苷酸链的降解法实现DNA测序 第一代测序技术主要代表为:sanger法:由于ddNTP的2´和3´都不含羟基,在DNA合成反应中不能形成 磷酸二酯键,因此可以被用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例的带有放射性同位素...
高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; ...
哈佛医学院Steven McCarroll团队[1]将微流体技术引入单细胞RNA-Seq,设计开发出Drop-Seq。 该技术主要利用微流体装置将单个细胞与带有特异性条码引物(Barcode)的微珠(bead)一起分离到微小液滴中进行杂交标记实现大规模、高度平行、基因来源可追述的单细胞测序。
miRNA-seq是一种建库方法和数据处理上都稍有特殊的一种测序方法。它的原理是首先提取短链RNA,直接在RNA两端连接接头后建库,然后对所有小RNA进行一起测序,通过数据处理提取出其中潜在的miRNA并进行表达量分析。由于小RNA的长度都很短,所以50bp长的单端测序已经足够可以获得全长序列。