RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
第三,高通量scRNA-seq方法只能检测转录本3 '或5 '端的短片段,这限制了临床样本的突变和剪接分析,特别是对肿瘤。 为了克服这些挑战,研究人员开发了“高通量高灵敏度单核总RNA测序”(snHH-seq),将随机引物和预索引策略结合在液滴微流控平台...
每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基因是活跃的,以及转录了多少。我们可以使用RNA-Seq去检测正常细胞和突变的细胞中的基因表达。然后我们就可以比较这两种细胞类型,在突变细胞中找出它们的不同之处。 image-20201231152706135.pn...
在进行大规模高通量RNA测序(RNAseq), 采用了一种计算方法, 计算方法集成在JXJY_RECOUNT中。在智能算法中,集成了一个由750000多个公开可用的人类和小鼠RNA测序(RNA seq)样本组成的资源数据库。 这些样本采用统一的单轨分析管道统一处理。为了便于在分析过程中访问和使用数据,佳学基因提供了JIAXUE_RCOUNT3和JIAXUEQUICK...
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
图1. RNA-seq常规分析流程 叨叨完毕,进入正题。 进入尔云后,打开“测序数据处理”模块,我们会看到图2的结果。在这一模块,我们可以完成RNA-seq数据分析的前两步:1、数据质控和过滤低质量数据;2、基因组组装,计算基因表达量。对于上面两部,尔云又根据是双端测序还是单端测序,分了两块。以edgeR为例,输出的DEGs.tx...
在微生物学领域,高通量测序可对微生物进行精准检测,以帮助控制疫情和病害爆发。 RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学，由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平（GEL）的测量，GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用，但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
AQRNA-seq已经通过国际PCT申请,并在美国、中国和欧洲获得专利授权,该技术的商业化试剂盒也在开发过程中,将推动RNA测序进入绝对定量新时期。据悉,近期曹博教授课题组已经成功开发AQRNA-seq 新版本(version 2.0),通过进一步设计并优化多个关键步骤,在绝对定量的基础上,实现了PCR dimer-free的建库技术。该版本可以与现有...