这种方法被称为3' -Digital Gene Expression (3'-DGE) RNA-Seq,这种方法的测序深度只需要3-10M。如果使用得当,相比于常规的全转录本RNA-Seq(Full-Transcript (FT) RNA-Seq),它可以帮助研究人员节约很大的成本来进行差异表达分析和定量转录组分析。 3'-Digital Gene Expression(3'-DGE)RNA-Seq是一种相对较新...
本次推送为大家献上一份ICELL8 cx单细胞分选系统用户可以参考的《单细胞长读长测序建库方案》。 基于ICELL8 cx系统的SMART-Seq应用工作流程,将和Oxford Nanopore Technology(ONT)一起奉献一场精彩的表演。 在该建库方案中,以单细胞起始,通过ICELL8 3'DE引物和5' SMART引物来合成cDNA及扩增。反转录酶首先以Oligo...
RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
在微生物学领域,高通量测序可对微生物进行精准检测,以帮助控制疫情和病害爆发。 RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
在过去的十年中,RNA测序(RNA-seq)成为差异基因表达、mRNA差异剪接等研究场景不可或缺的重要手段。随着高通量测序技术的不断发展,RNA-seq的研究技术、分析方法也在不断发展。现在RNA-seq用于研究RNA相关的各方面生物学问题,包括单细胞基因表达、RNA翻译、RNA结构、空间转录学、全转录组、RNA-蛋白互作等。早前 Nature...
RNAseq,即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术,作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今,RNAseq在转录本变异检测,基因融合检测,可变剪切检测等场景均有大规模的应用。转录本变异检测,是指通过比较样本RNA序列和参考基因组对应序列,来寻找单碱基多态性和小片段的插入缺失,其结...
第二代测序技术称为高通量测序(High-ThroughputSequencing),又名下一代测序(Next Generation Sequencing NGS)。顾名思义,它们解决了第一代测序中的低通量的缺陷,同时大大降低测序成本,目前使用最广的是illumina公司的Solexa,Hiseq技术,其核心技术大致相同,介绍如下-- ...
转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或...