RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
Cozen等利用这些修饰会引起逆转录终止的性质在tRNA中鉴定其位点, 提出了一种AlkB促进的RNA甲基化测序方法 (Alk B-facilitated RNA methylation sequencing, ARM-seq) 。 在ARM-seq中, 通过AlkB处理RNA去除m1A、m1G和m3C的甲基化修饰以获得全长的cDNA;然而, 未经处理的RNA将产生提前终止的cDNA。因此, 通过比较处理...
高通量测序的主要原理是将DNA或RNA分子随机断裂成大量小片段,并在流式细胞仪上进行高通量并行的测序。具体步骤包括DNA或RNA的提取、断裂、连接、扩增和测序。其中,连接和扩增两个步骤是高通量测序技术的核心。连接步骤通过引入序列适配器使小片段能够在流式细胞仪上辨识和区分,从而有序地对这些小片段进行同时测序。扩...
通过对small RNA大规模测序分析,可以从中获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现包括新Small RNA分子的挖掘,其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、small RNA聚类和表达谱分析等科学应用。 什么是lncRNA测序? lncRNA是一类长度大于200nt的非编码RNA,不能编...
常规的small RNA 测序,一般是指microRNA(miRNA),是一类存在于动植物体内、大小为21-25nt的内源性非编码单链小分子RNA,对转录后的基因表达调控起重要作用。大量研究表明,microRNA在正常发育过程以及疾病发生过程中具有重要的作用,在诊断和治疗领域具有光明的应用前景。
RNA高通量测序可以通过全转录组测序和小RNA测序等方法,揭示基因的启动子和转录因子结合位点信息,进一步研究基因调控网络和转录因子的作用机制。 外显子组测序 RNA高通量测序可以对外显子组进行测序,帮助研究者揭示外显子的可变剪接和基因突变等信息,从而发现疾病相关的变异和突变。 非编码 RNA高通量测序可以帮助研究者...
高通量基因测序仪在DNA检测水平可实现全基因组测序、微生物扩增子测序及宏基因组测序、大规模筛查基因突变和基因多态性分析、全基因组甲基化测序、ATAC-SEQ测序等;在RNA水平可实现转录组测序、全转录组测序、长链非编码RNA测序、RNA可变剪切及...
因为RNA测序其实想得到的是mRNA的信息,但是总RNA当中绝大部分都是核糖体RNA,这些RNA的信息是无用的,所以需要去掉核糖体RNA,然后,将mRNA富集之后去做测序.结果一 题目 高通量测序,RNA测序为什么要除去核糖体RNA 答案 因为RNA测序其实想得到的是mRNA的信息,但是总RNA当中绝大部分都是核糖体RNA,这些RNA的信息是无用的...
在进行大规模高通量RNA测序(RNAseq), 采用了一种计算方法, 计算方法集成在JXJY_RECOUNT中。在智能算法中,集成了一个由750000多个公开可用的人类和小鼠RNA测序(RNA seq)样本组成的资源数据库。 这些样本采用统一的单轨分析管道统一处理。为了便于在分析过程中访问和使用数据,佳学基因提供了JIAXUE_RCOUNT3和JIAXUEQUICK...