传统的二代测序中,最为人熟知的就要数RNA-seq了。RNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA(bulk RNA)进行测序,能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据,细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖(比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体)。而随着对生物结构...
RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
传统的二代测序中,最为人熟知的就要数RNA-seq了。RNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA(bulk RNA)进行测序,能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据,细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖(比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体)。而随着对生物结构功能的深入研究,人们越来越清楚地认识到,哪怕看似相同...
RNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA(bulk RNA)进行测序,能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据,细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖(比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体)。而随着对生物结构功能的深入研究,人们越来越清楚地认识到,哪怕看似相同的细胞群,细胞之间的转录组表达水平也是存在差异的。
在基因组分析上更进一步,我们会对基因表达,可变剪切,基因结构变化等内容感兴趣。所以我们需要使用到转录组测序,即RNA-seq。也就是从总的RNA中富集出单链mRNA,再反转录成双链cDNA,随后进行高通量测序,并与基因组DNA序列进行比对。 通过RNA-seq,还可以发现新的转录物。长链非编码RNA(lncRNA)是当前研究的热点,其功...
传统的二代测序中,转录组测序(RNA-seq)最为人所熟知。RNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA(bulk RNA)进行测序,能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据,细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖(比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体)。而随着对生物结构功能的深入研究,人们越来越清楚地认识到,哪怕看似...
RNA-Seq简介 举个例子,现在我们有一群正常的神经细胞,一群突变的神经细胞,突变细胞的行为与正常细胞不同。我们想知道是什么遗传机制造成了这种差异,这意味着我们想要观察基因表达的差异。每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基...
传统的二代测序中,最为人熟知的就要数RNA-seq了。RNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA(bulk RNA)进行测序,能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据,细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖(比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体)。而随着对生物结构功能的深入研究,人们越来越清楚地认识到,哪怕看似相同...
转录组测序RNA-Seq是基于二代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集,然后反转录为 cDNA后进行的高通量测序,在此基础上进行片段的拼接组装,从而可得到一个个的转录本,进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行...