本文将对联合分析转录组和代谢组的方法和应用进行探析。 一、联合分析的方法 转录组分析通常通过RNA测序技术对mRNA进行定量分析、注释和差异表达分析等。代谢组分析则包括代谢产物的定量分析和代谢途径的构建等。而联合分析则是综合两种技术所提供的数据来揭示基因和代谢产物之间的相互关系。下面介绍一些常用的方法。 1....
一.联合分析的介绍 在研究生物体基因表达和调控中,转录组学和代谢组学的独立研究已经获得了许多研究成果。转录组学可以确定基因表达特征和调控网络,代谢组学可以分析代谢通路、代谢产物含量和变化规律。然而,这两种方法独立的分析只能了解到一部分生物机制。转录组和代谢组之间存在着复杂的相互调控和交互作用。因此,将转录...
转录组与代谢组的关联分析方法主要包含以下内容:基于KEGG通路的注释和富集分析、基于皮尔逊的相关性分析和基于降维的模型构建确定关联关系。转录组与代谢组联合分析的方法已在许多重要的农作物上应用,包含小麦、大豆、番茄、玉米、棉花、烟草和水稻等。笔者综述了近年来国内外转录组和代谢组联合分析在植物逆境胁迫和生长...
目前转录组学测序分析常用技术包括基于杂交的技术,如DNA 微阵列(DNA microarray);基于标签的技术,如基因表达序列分析(SAGE);以及基于直接测序技术,如转录组测序(RNAseq)等[10],其中,DNA 微阵列技术成熟,数据库庞大,但只适用于检测已知序列,检测灵敏度低;SAGE 技术能够大量获取基因组范围基因表达的类别与丰度,从而应...
点击查看下载代谢组+转录组联合分析迈维代谢代谢组 应用于基因/测序相关资料,进一步了解产品。 转录组简介 组织:≥300 mg;RNAlater保存,新鲜组织样本冰上分割 50 mg小块,分管备份,浸泡在5倍体积的RNAlater,充分浸润后,—80℃保存。 血液:全血至少2ml;普通TRIzol 法, Trizol与血液按3:1进行制备。 细胞:≥5×106...