转录组和蛋白组联合分析研究思路 对于蛋白质组和转录组的联合分析,我们首先得到蛋白质组和转录组的定量检测分析结果,通过提取有对应关系的蛋白质和转录本展示其一致性情况,并可进一步映射到相关代谢通路上(图1)。接下来,小派将进一步给大家带来精彩的实战案例。 图1 转录组和蛋白组联合分析思路 常规转录组+蛋白组联合...
转录组测序是基于高通量测序技术，对特定生物样本中所有RNA转录本进行测序，从而获取基因表达水平、转录本结构变异等信息。这种方法具有高通量、高灵敏度和高分辨率的特点，能够全面反映生物体内转录水平的动态变化。蛋白组测序则是利用质谱技术等方法，对生物样本中的蛋白质进行定性和定量分析。蛋白组测序能够直接反映蛋白质...
综上所述,本案例主要是以“转录组+DIA蛋白组”作为组学研究策略,分析思路如下所示, 1、单组学分析:差异分析、富集分析; 2、关联分析:共富集通路分析、PPI网络分析→确定关键富集通路、筛选目的基因; 3、目的基因功能研究:目的基因序列组成分析、编码蛋白结构预测;目的基因对菌株生物功能的影响。 案例中的组学分析内容...
(1)两组学的联合分析可以获得基因的转录组与蛋白组学表达水平,实现两者的互补,对特定状态下生物体中mRNA和蛋白质表达水平进行全方位分析。 (2)将转录组和蛋白组联合分析可以获得对差异表达的深层分析,挖掘受转录后调控的差异基因或差异蛋白,寻找并验证某些重要的调控通路。 (3)对于那些蛋白数据库缺乏或注释不全的物...
本文总共4个主图,研究思路也比较清晰简单:取样进行转录组测序→分析APA位点,疾病组与对照组比较差异→短3’UTR亚型和长3’UTR亚型比较→转录组差异基因与蛋白质组差异蛋白联合分析和通路富集→短3’UTR亚型和长3’UTR亚型举例简单验证→APA相关调控蛋白表达分析。其中比较重要的两部分已红色标注,下面我们大致过一下研...
转录组和蛋白组分析是研究真核生物基因组的两种最重要的技术之一,转录组法可以反映mRNA的表达状态,从而获得基因的功能;而蛋白组分析法能够反映蛋白质的表达状态,因此可以获得蛋白质的结构和功能。 联合分析是利用转录组与蛋白组联合对基因和蛋白质进行系统分析的一种方法。通过联合分析基因与蛋白质的关系,可以获得基因...
中科新生命一直深耕于蛋白质组、代谢组、转录组、微生物组及多组学联合技术服务,也非常荣幸参与了多项科研工作的组学分析部分。据不完全统计,2022年全年共收录到客户项目文章567篇,其中包括Nature,Cell Research、Molecular Cancer、Signal Transduction and Targeted Therapy,Cell Host & Microbe、Nature Biomedical Engineer...
(2)一次刺激与二次刺激后BMDM的转录组学分析 将MRL/lpr小鼠的BMDM分为对照组(A)、一次刺激组(B)和二次刺激组(C),(见图1),并进行转录组学分析。结果发现,与未刺激的BMDM相比,在一次刺激和二次刺激时,有某些共同的差异基因参与了组蛋白甲基化和乙酰化过程。
蛋白组和转录组联合分析，旨在将蛋白质组学和转录组学的数据结合起来进行分析。转录组指给定生物或实验样品中存在的所有核糖核酸（RNA）转录本。目前，可以通过与筛选DNA相似的策略，即微阵列和测序技术，捕获几乎全部的转录组。其中转录组测序更为全面，可以实现覆盖率更高的基本捕获任何形式的RNA。蛋白质组是给定细胞...