近日,来自德国分子生物学研究所的Petra Beli团队以K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution为题在Molecular Cell杂志发表了其最新的研究成果,他们发现甲醛能够诱导RNA-蛋白质交联物(RNA-protein crosslinks,RPCs)并停滞核糖体,抑制蛋白质翻译。另外,在mRNA上的RPCs能够核糖体...
近日,来自德国分子生物学研究所的Petra Beli团队以K6-linked ubiquitylation marks formaldehyde-induced RNA-protein crosslinks for resolution为题在Molecular Cell杂志发表了其最新的研究成果,他们发现甲醛能够诱导RNA-蛋白质交联物(RNA-protein crosslinks,RPCs)...
这可以解释为,来自RBP界面的残基可能通过单线态O2反应交联RNA(例如赖氨酸残基的胺直接交联鸟苷的光氧化产物)。我们从HEK293细胞中提取交联RNA-蛋白复合物,并用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析样品。我们通过PhotoCAX-MS分析在三个...
将PhotoCAX 技术应用于活细胞中 RNA-蛋白质相互作用的全局分析。从 HEK293 细胞中提取交联的 RNA-蛋白质复合物,并用液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 分析样品。在这个 PhotoCAX-MS 分析中,在三个独立实验中总共鉴定了 2044 种蛋白质,其中至少有两次重复实验中的 1402 种蛋白质。其中,827 种蛋白质以前没有通过...
一、实验原理紫外交联仪的实验原理是利用紫外线照射将RNA与蛋白质进行交联。在实验中，先将样本进行紫外线照射，使RNA与蛋白质的分子链产生共价结合，从而将它们长久地连接在一起。这种交联反应可以在细胞或组织样本中的RNA和蛋白质之间建立长久的相互作用关系。二、实验步骤 1.样本准备在进行紫外交联实验之前，首先需要...
B、紫外线交联免疫共沉淀(CLIP)已被开发为使用UV测定RNA-蛋白质复合物体内交联的常用方法,B正确; C、RNA pull-down实验是一种用于寻找RNA靶标的实验方法,它结合了RNA杂交技术和亲和层析技术,该实验的主要原理是利用一种与目标RNA互补的DNA探针固定在琼脂糖珠上,通过混合样品中的RNA和蛋白质来鉴定RNA的结合伴侣,可...
亚甲基蓝介导的光交联反应检测蛋白质与双链RNA的相互作用实验实验方法原理 亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构,亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合,插入碱基。浓度较高时,亚甲基蓝带阳离子,可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。实验材料 RNA试剂、试 202...
核酸凝胶电泳实验:能够固定凝胶中的核酸分子,使其发生化学交联,有助于后续对核酸分子的染色和分析,提高实验的准确性和可靠性。 CLIP - seq实验(紫外交联免疫沉淀结合高通量测序):基于RNA分子与RNA结合蛋白在254nm紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA - 蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加...
用蛋白酶 K 消化 RNA-蛋白交联物,生成的 RNA-蛋白交联物中的多肽仅含存较少的氨基酸:用 50 μl 蛋白酶 K 反应缓冲液重悬从胶中纯化得到的 RNA-蛋白交联物,加入 1 μl 蛋白酶 K 储存液(2.5 mg/ml ),于 37℃ 反应 30 min。 乙醇沉淀 RNA-蛋白交联物(方法同前),变性胶电泳纯化 RNA 产物(方法同前...
可以用来检测蛋白质与RNA分子相互作用的方法有( )A.染色质免疫共沉淀B.紫外线交联免疫共沉淀C.RNApulldownD.RNA免疫沉淀-e卷通组卷网