UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳，最出名的当属IEU OPEN GWAS（https://gwas.mrcieu.ac.uk/）。使用IEU调取UKB-gwas比较简单，直接搜索表型，然后UKBB的也会被搜索出来，通过ID直接调取就好了，IEU已经对数据重新进行了质控和检验，所需要的变量都应经存在。GWAS Catalog数据库也纳入了很多UKB数据(https://www...
数据来源数据集/队列数据库详细信息UKB数据UK Biobank英国约50万名成年人的健康和遗传信息GTEx数据Genotype-Tissue Expression各种人类组织的基因表达数据 研究思路本研究利用UK Biobank的数据,通过主成分分析(PCA)定义了四种体型,并对这些体型进行了全基因组关联研究(GWAS)以识别相关的遗传变异。进一步通过Genotype-Tissue E...
MR是工具变量(IV)分析的一个特殊情况,遗传标记被用来作为工具来推断因果关系。由于出生时基因变异的随机分配,MR可以推断暴露和结果之间的因果关系,避免反向因果关系和混淆。在本研究中,作者首先对来自GWAS汇总级数据进行处理,采用双样本孟德尔随机化(MR)来分析研究伴侣特征的相似性。通过直接和间接的分析,探讨了跨特质伴...
3.遗传易感性在癫痫-心律失常关联中的相关性 为了评估心律失常遗传易感性在癫痫与心律失常长期风险之间的关联中的作用,作者使用FinnGen联盟中的GWAS汇总统计数据作为基础数据,生成心律失常的多基因风险评分(PRS),利用样本中的平均值和标准差将 PRS 归一化为 z 分数(PRS-z),分数越高,表明心律失常的遗传风险越大。首...
.英国生物库演示用户指南:入门 1 简介 英国生物库拥有2006年至2010年间在英国招募的50万40-69岁参与者(男女人数大致相等)的前所未有的数据。展示(可在http://www.ukbiobank.ac.uk)旨在以全面简洁的方式提供可用于健康相关研究的数据,并为考虑申请使用该资源的...
Column header Description variant_id The identifier of the variant : rsID or genome coordinate i.e. rs7329174 or 1:1235_C_G p_value The p-value of the variant/trait association chromosome The chromosome that the variant is located on ...
Plling et al. 2017 UKB parents attained age GWASPilling, Luke
游戏 二次元 音乐 美食 大脑MRI的3935个GWAS数据(UKB数据库)!#医工科研kim老师#医工科研云上GWAS#数据分析#生信分析@抖音小助手@抖音创作者中心 抢首评 发布时间:2024-03-18 22:28 孟德尔随机化课程客服 粉丝82获赞242 韩国国务总理韩德洙:将全力维护国政稳定 ...
"# Train a Classifier to assign causal genes (UKB NMR 500K GWAS )" ] }, { "cell_type": "code", "execution_count": null, "metadata": {}, "outputs": [], "source": [ "# imports\n", "import numpy as np\n", "import pandas as pd" ] }, { "cell_type": "code", "executi...
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...