UKBB-gwas数据被很多汇总数据库收纳，最出名的当属IEU OPEN GWAS（https://gwas.mrcieu.ac.uk/）。使用IEU调取UKB-gwas比较简单，直接搜索表型，然后UKBB的也会被搜索出来，通过ID直接调取就好了，IEU已经对数据重新进行了质控和检验，所需要的变量都应经存在。GWAS Catalog数据库也纳入了很多UK
由于出生时基因变异的随机分配,MR可以推断暴露和结果之间的因果关系,避免反向因果关系和混淆。在本研究中,作者首先对来自GWAS汇总级数据进行处理,采用双样本孟德尔随机化(MR)来分析研究伴侣特征的相似性。通过直接和间接的分析,探讨了跨特质伴侣的相似性是如何出现的。最终结果显示了间接分类增加观察到的伴侣相似性的机制...
作者首先对来自GWAS汇总级数据进行处理,在蛋白质组范围内采用双样本孟德尔随机化(MR)来分析肥胖对COVID-19严重程度影响,并采用反方差加权(IVW)方法、MR-PRESSO和MR-Egger回归检验以及敏感性分析来进行检验。该研究可能为肥胖如何影响COVID-19的严重程度提供了可操作的见解哦~(PS:没有思路、不知道怎么创新的宝子们,...
把UKB临床数据库分析、药物靶标SMR分析和GWAS遗传易感性分析这3大创新版块联合在一起的发文威力就是强大呀!整体数据量很庞大,但分析方法并不复杂,真的超级适合临床医生了!文章是中南大学湘雅三院的陆瑶团队发表,临床医生都在用这类思路思路发高分了,你还不来尝试一下?
.英国生物库演示用户指南:入门 1 简介 英国生物库拥有2006年至2010年间在英国招募的50万40-69岁参与者(男女人数大致相等)的前所未有的数据。展示(可在http://www.ukbiobank.ac.uk)旨在以全面简洁的方式提供可用于健康相关研究的数据,并为考虑申请使用该资源的...
孟德尔随机实验中UKB和芬兰数据库的数据获取方法如下：UKB数据库的数据获取： 访问IEU OpenGWAS项目：在R语言中，可以通过访问IEU OpenGWAS项目来查找UKB数据库中的所需数据集。 搜索并选择研究项目：在IEU OpenGWAS项目中，搜索感兴趣的研究项目，并选择相应的研究项目。 下载数据：点击“studies accession...
数据安全方面,所有操作应在UKBiobank授权平台完成,中间文件加密存储,访问日志保留不少于五年。成果发表时,样本量描述需注明最终纳入分析的合格案例数及排除标准。 质量控制体系应贯穿全过程。数据采集阶段设置双录入核对机制,算法开发阶段实施版本控制,结果解释阶段要求至少两位研究者独立验证。对于GWAS研究产生的分类结果,需...
汇总数据库 UKB-GWAS数据广泛被纳入多个汇总数据库，其中IEU OPEN GWAS最为知名。通过搜索特定表型，即可获取UKB相关数据，无需额外质控与检验，所需变量均在数据库中。若在IEU中未找到所需疾病数据，可继续在其他数据库中寻找，如GWAS Catalog。GWAS Catalog收录了大量UKB数据，下载流程较为复杂，建议参考...
近日,中国科学技术大学团队、阿里巴巴团队联合美国北卡罗来纳大学团队,通过整合来自英国生物银行的多模态数据,提出了可预测和评估1560种疾病健康风险的综合框架UKB-MDRMF。与单一疾病模型不同,UKB-MDRMF结合了多发病机制,具有更高的预测准确性,在所有疾病类型的风险评估中都表现更好。研究团队利用UKB-MDRMF预测和评估了...
二次元 音乐 美食 大脑MRI的3935个GWAS数据(UKB数据库)!#医工科研kim老师#医工科研云上GWAS#数据分析#生信分析@抖音小助手@抖音创作者中心 抢首评 发布时间:2024-03-18 22:28 孟德尔随机化课程客服 粉丝82获赞242 韩国国务总理韩德洙:将全力维护国政稳定 ...