北京时间2024年11月5日，中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所（国家生物信息中心），在Cell上发表研究成果，利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，构建了全球首份多器官衰老时空图谱，增强了对衰老生物学机制的理解，找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物，并为进一步探索衰老的...
Stereo-seq技术能同时“拍到”组织里每个细胞的基因信息和空间位置，其使用的芯片是研究人员基于华大自主研发的DNBSEQ测序技术研制的具有空间位置信息的、阵列式排布的DNA纳米球空间捕获芯片。该芯片可以实现超高精度和超大视野的生命分子成像，其分辨率可达500纳米（单个细胞可被400个像素点捕获），实现亚细胞定位。同时，该...
北京时间2024年11月5日,中国科学院动物研究所携手华大生命科学研究院、北京基因组研究所(国家生物信息中心),在Cell上发表研究成果,利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,构建了全球首份多器官衰老时空图谱,增强了对衰老生物学机制的理解,找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物,并为进一步探索衰老的干预策略...
此研究利用单细胞空间增强分辨率组学测序(scStereo-seq),展现了真正的拟南芥叶片的单细胞空间转录组谱,并成功区分了上表皮细胞和下表皮细胞之间细微但显著的转录组差异。此外,从主叶脉到叶缘的细胞类型特异性基因存在表达梯度,从而发现了维管细胞和保护细胞不同的空间发育轨迹。研究结果展示了单个细胞的物理位置在植物中...
从信息维度层面,Stereo-seq可以在延续单细胞测序分析逻辑的同时加入空间坐标维度,能够实现整体和局部空间区域内多种细胞个体及个体之间的关联信息的解读。然而,空间组学的分子检测不以细胞为基本单元,空间转录组数据必须借助算法来生成细胞意义上的转录组信息。华大自主研发的基于Stereo-seq系列的CellBin一站式细胞分割方案...
Stereo-seq技术将认识生命空间表达的分辨率提高到500nm的亚细胞层级;可以通过图像识别细胞核位置,并结合算法实现单个细胞及分子信息的空间定位和检测;也可以通过binning的方式,识别组织中的不同功能区域。 如果您计划开展Stereo-seq的科研项目,欢迎联系我们~ 关于我们 ...
2021年1月19日,深圳华大生命科学研究院联合国内外多机构共同开发的全新空间转录组测序技术:Stereo-seq对外发布,该技术以前所未有的(亚细胞级)分辨率对组织切片进行高通量转录组分析,区域可扩展到厘米级,具有高灵敏度和均匀的捕获率。相关研究内容已经在BioRxiv上进行了预印刊载。
本次大会上,廖莎从通用性和引领性两方面重磅发布了Stereo-seq的技术突破和新品体验计划。 ►►► 通用性 在通用性方面,华大时空从样本和操作性出发,提升Stereo-seq技术的可及性。 样本可及性 在样本可及性上,Stereo-seq实现了将在液氮或-80℃...