尽管基于测序的空间转录组技术（sequencing-based spatial transcriptomics，简称sST）显著促进了生物学领域在空间基因表达测量方面的进步，但由于技术和数据集之间的差异性，该领域目前仍缺乏全面的基准测试研究。2024年7月4日，广州实验室田鲁亦团队和西湖大学刘晓东团队联合墨尔本大学、哈佛大学等研究团队在Nature Methods发表...
Stereo-seq(Spatial Enhanced Resolution Omics-sequencing)作为一种空间转录组学技术,能够以高分辨率在组织切片上捕捉基因表达的空间分布,这对于理解疾病的发生和发展至关重要。通过Stereo-seq,可以在单细胞或细胞群体的水平上绘制出基因表达的空间图谱,从而揭示组织中的细胞异质性、细胞间相互作用以及病理特征的空间分布。
2020年,华大自主研发出超高分辨率的“生命全景照相机”Stereo-seq(Spatial Enhanced REsolution Omics-sequencing),该技术基于DNA纳米球测序芯片,实现了500 nm的分辨率,同时捕获面积可达13 cm×13 cm。 目前,Stereo-seq已被成功应用到胚胎和器官发育、再生医学、肿瘤研究等多个领域,相关成果分别以专题和封面文章形式发表...
尽管基于测序的空间转录组技术(sequencing-based spatial transcriptomics,简称sST)显著促进了生物学领域在空间基因表达测量方面的进步,但由于技术和数据集之间的差异性,该领域目前仍缺乏全面的基准测试研究。2024年7月4日,广州实验室田鲁亦团队和西湖大学刘晓东团队联合墨尔本大学、哈佛大学等研究团队在Nature Methods发表了一...
尽管基于测序的空间转录组技术(sequencing-based spatial transcriptomics,简称sST)显著促进了生物学领域在空间基因表达测量方面的进步,但由于技术和数据集之间的差异性,该领域目前仍缺乏全面的基准测试研究。2024年7月4日,广州实验室田鲁亦团队和西湖大学刘晓东团队联合墨尔本大学、哈佛大学等研究团队在Nature Methods发表了一...
Stereo-seq全称为Spatial enhanced resolution omics-sequencing,一经出道,就以其纳米级的分辨率、厘米级全景视场吸引大家的眼光。仅2024年,时空组学技术Stereo-seq已助力研究人员在多个权威期刊上发表了近40篇高质量的文章,包括Nature(IF:50.5)、Cancer Cell(IF:48.5)、Cell(IF:45.5)、Science(IF:44.7)等顶尖期刊,...
2020年,华大自主研发出超高分辨率的“生命全景照相机”Stereo-seq(Spatial Enhanced REsolution Omics-sequencing),该技术基于DNA纳米球测序芯片,实现了500 nm的分辨率,同时捕获面积可达13 cm×13 cm。 目前,Stereo-seq已被成功应用到胚胎和器官发育、再生医学、肿瘤研究等多个领域,相关成果分别以专题和封面文章形式发表...
① 结合DNA纳米球(DNB)模式阵列和原位RNA捕获技术,建立了Stereo-seq(SpaTial Enhanced REsolutionOmics-sequencing)技术,相较当前其他空间转录组技术,该技术拥有最大的捕获面积(最大174.24 cm2)、最灵敏的基因捕获(1,450个UMI/100μm2)和...
Stereo-seq全称为spatial enhanced resolution omics-sequencing,一经出道,就以其纳米级的分辨率、厘米级全景视场吸引大家的眼光。仅2024年,时空组学技术Stereo-seq已助力研究人员在多个权威期刊上发表了近40篇高质量的文章,包括Nature(IF:50.5)、Cancer Cell(IF:48.5)、Cell(IF:45.5)、Science(IF:44.7)等顶尖期刊,...
sequencingbased (sST):转录本的空间定位可以在其释放到载玻片上的过程中被改变,Stereo-seq v1.3 和 Visium HD FFPE 都存在组织边界外的转录本扩散情况,通过分析组织区域外检测到的转录本并测量它们与组织边界的距离,来评估扩散程度。两种技术都存在组织边界处的转录本扩散(2d),但 Stereo-seq v1.3相比 Visium HD...