Stereo-seq Stereo-seq，时空组学技术，2022年9月，由杭州华大生命科学研究院主导，联合3个国家的17家单位 研究团队基于时空组学技术Stereo-seq，完成了全球首个蝾螈脑再生时空图谱 。
Stereo-seq技术将认识生命空间表达的分辨率提高到500nm的亚细胞层级;可以通过图像识别细胞核位置,并结合算法实现单个细胞及分子信息的空间定位和检测;也可以通过binning的方式,识别组织中的不同功能区域。 如果您计划开展Stereo-seq的科研项目,欢迎联系我们~ 关于我们 武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉...
其中,华大发布的Stereo-seq技术同时具有“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的优势,可以助力构建生命科学各类器官和组织的空间图谱、挖掘生物体发育和再生的时空景观、揭示疾病发生发展过程中的分子机制等。截至2024年9月,利用Stereo-seq技术发表的研究性论文83篇,综述23篇,预印61篇。 Stereo-seq为深入解析组织结构和...
研究团队利用Stereo-seq绘制了牙龈组织的高分辨率空间转录组图谱,并对上皮细胞、成纤维细胞、内皮细胞和免疫细胞等牙龈四种主要细胞类型进行可视化。进一步对牙龈上皮细胞的空间异质性进行了深度分析,通过聚类分析确定了牙龈上皮细胞的3个亚群,发现与正常牙龈组织相比,炎症牙龈组织基底层细胞增加。研究团队结合单细胞数据,还...
Stereo-seq*是华大自主研发的时空转录技术,该技术基于DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB)开发,具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术、可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,并...
2020年,华大自主研发出超高分辨率的“生命全景照相机”Stereo-seq(Spatial Enhanced REsolution Omics-sequencing),该技术基于DNA纳米球测序芯片,实现了500 nm的分辨率,同时捕获面积可达13 cm×13 cm。 目前,Stereo-seq已被成功应用到胚胎和器官发育、再生医学、肿瘤研究等多个领域,相关成果分别以专题和封面文章形式发表...
本次大会上,廖莎从通用性和引领性两方面重磅发布了Stereo-seq的技术突破和新品体验计划。 ►►► 通用性 在通用性方面,华大时空从样本和操作性出发,提升Stereo-seq技术的可及性。 样本可及性 在样本可及性上,Stereo-seq实现了将在液氮或-80℃...
stereo-seq原理 哎呀,说起stereo-seq,这玩意儿可真是个技术活儿。你知道的,stereo-seq,就是立体序列,这玩意儿在生物信息学里头可火了。它的原理,简单来说,就是通过分析DNA序列,来预测蛋白质的结构和功能。这就好比你拿着一张建筑图纸,就能想象出房子长啥样,stereo-seq就是那个帮你“看”蛋白质的图纸。 咱们...
其中,北京时间2023年6月19日,华大生命科学研究院等团队基于Stereo-seq结合单细胞建库平台,首次解析了肿瘤细胞侵袭正常肝细胞过程中交界线周围区域的细胞组成、分子特征及交互作用,精确定义了以肿瘤边界为中心500 μm宽的区域为肿瘤“侵袭前沿区”,在肿瘤侵袭与进展中发挥关键作用。该研究成果以封面形式发表于国际学术期刊...