在全球顶尖学术期刊 《细胞》(Cell)上发表了最新研究成果,利用华大自主研发的“超广角百亿像素生命照相机”——时空组学技术Stereo-seq,构建了全球首份多器官衰老时空图谱,增强了对衰老生物学机制的理解,找到了可用于衰老预警和评估的新型生物学标志物,并为进一步探索衰老的干预策略奠定了理论基础。
而在本研究中,研究团队利用华大堪称“超广角百亿像素生命照相机”的时空组学技术Stereo-seq,对小鼠、狨猴和猕猴的小脑进行了分析,绘制了这三种常见模式生物的小脑时空图谱,这个图谱就像是一张详细的高清小脑地图,展示了小脑中各种细胞的种类、基因表达情况、空间分布以及它们之间的相互关系。 通过研究图谱中基因表达的模式...
研究团队选取了2、4、13、19和25月龄的小鼠(相当于人类从青年到老年),利用时空组学技术Stereo-seq对它们的心脏、肝脏、脾脏、肺、小肠等9个器官进行了分析,最终形成了一张包含72个细胞类型的多器官衰老时空图谱。这些图谱不仅能“看到”不同细胞内基因的表达情况,还能精确定位每个细胞的位置,如同一部生命衰老的纪录...
研究论文第一作者、BGI-Research高级研究员Xiaoyu Wei博士说道:“我们的团队分析了蝾螈大脑再生过程中的重要细胞类型并跟踪了其空间细胞谱系的变化。Stereo-seq所揭示的关键细胞类型的时空动态为我们提供了一个强大的工具,从而为生命科学铺设新的研究方向。” 通讯作者、BGI-Research生命科学部主任Xun Xu则指出:“在自然...
Stereo-seq数据集获取网址:https://db.cngb.org/stomics/artista/ 。 本研究原始数据通过CNSA数据库获得,数据编号为CNP0002068;分析代码获取网址:https://github.com/BGI-DEV-REG/ARTISTA。 ►►► 特别关注 9月16日,ICG-17青年学...
华大时空组学技术Stereo-seq自推出以来,已成功应用于#胚胎发育#、#脑科学#、#器官再生#、#疾病# 等研究领域,助力系列研究项目取得重要成果,包括迄今最完整的灵长类脑细胞图谱、全球首个脑再生时空图谱、小鼠胚胎发育时空图谱等。今天我们邀请猕猴脑细胞图谱研究的部分主创作者,为大家讲述背后的故事,一起来听听吧 L华...
为了探究Nlgn3在星形胶质细胞中发挥作用的机制,研究人员利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,结合高精度DNBSEQ测序平台,对小鼠大脑进行了“高清扫描”,发现Nlgn3在星形胶质细胞的胞体区域而非末梢。或许这一发现也解释了为何敲除Nlgn3不影响突触数量和功能。 小鼠大脑时空图谱 深入的分子生物学研究进一步揭示,当星形...
Stereo-seq, a spatio-temporal omics technology independently developed by BGI Genomics, captures mRNA from tissue section by stereo chips and restores the spatial context by utilizing the spatial barcode (Coordinate ID, CID), thus establishing a solid research foundation for further understanding the ...
我国华大基因研究(BGI-Research)是华大基因集团的三个分支之一,另外两个是MGI和BGI Genomics。Ao Chen博士,时空组学首席科学家,华大基因生物化学研究所所长,2013年加入华大基因研究。Chen在公司的头几年是开发DNA纳米球技术(DNB-seq)团队的一员,该技术被用于MGI的测序仪。他们取得的部分进展是最大化纳米球的密度,并...
为了探究Nlgn3在星形胶质细胞中发挥作用的机制,研究人员利用时空组学技术Stereo-seq,结合华大智造DNBSEQ测序平台,对小鼠大脑进行了“高清扫描”,发现Nlgn3在星形胶质细胞的胞体区域而非末梢。或许这一发现也解释了为何敲除Nlgn3不影响突触数量和功能。 molecular psychiatry官网截图 ...