第二十六节:scRNA-seq和bulk RNA-seq数据联合分析推断细胞类群互作网络【Cell】 第二十七节:scATAC-seq分析Sequence motif enrichment and Transcription factor footprinting 【Nat Genet】 第二十八节:以Nature文章为例系统讲解scRNA-seq与scA...
一、此音乐伴奏价格为 20元 金币,歌名为 《不可能的可能 - 马健涛(192kbpsstereo!)》,伴奏下载的格式为 MP3。 二、本站所有伴奏都提供完整的加广告的在线试听,点击【试听】按钮,即可在线播放试听,实际下载的效果和试听的效果一样,除了没有广告声。如不能播放,可刷新重试或者换个浏览器,或联系客服。 三、特别...
针对bin模式的Stereo-seq或者标准模式HD分析,不做图像分割的情况下, 合并后的superspot都跟visium分析差不多,需要和单细胞数据一起进行解卷积。当然了,这就会有课程上讲到的分析,分子聚类、细胞聚类。 解卷积的方法么,一般都是cell2location、RCTD居多,当然了,像CellTrek、CellScope等方法也都有人引用,分析完拿到空...
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(1)doublet mode:每个spot分配1-2种细胞类型,推荐用于具有高空间分辨率的技术,如Stereo-seq、HD等(注意bin的大小); (2)full mode:每个spot分配任意数量的细胞类型,推荐用于具有低空间分辨率的技术,如Visium; (3)multi mode : doublet mode的扩展,可以每个spot发现两个以上的细胞类型,作为全模式的替代选项。