规划高效的CRISPR筛选始于针对感兴趣的基因或位点的sgRNA文库的设计。然后合成与sgRNA设计相对应的寡核苷酸池,并将其克隆到载体中以表达sgRNA,或转录成RNA以在将进行筛选的细胞系统中转染。合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提,sgRNA文库结合高通量筛选技术在药物研发、基因功能研究、分子诊断...
MTT检测LncRNA测序液相色谱LC/MS 细胞凋亡检测全基因组测序核磁共震NMR 细胞周期检测RNA-Seq测序 细胞克隆形成实验外显子测序影像学相关实验 Transwell细胞迁移/侵袭16s扩增子测序Micro-CT 流式分选Small RNA测序小动物活体成像 CCK8/XTT检测宏基因组测序核磁共振 ...
规划高效的CRISPR筛选始于针对感兴趣的基因或位点的sgRNA文库的设计。然后合成与sgRNA设计相对应的寡核苷酸池,并将其克隆到载体中以表达sgRNA,或转录成RNA以在将进行筛选的细胞系统中转染。 合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提,sgRNA文库结合高通量筛选技术在药物研发、基因功能研究、分子诊断、...
规划高效的CRISPR筛选始于针对感兴趣的基因或位点的sgRNA文库的设计。然后合成与sgRNA设计相对应的寡核苷酸池,并将其克隆到载体中以表达sgRNA,或转录成RNA以在将进行筛选的细胞系统中转染。 合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提,sgRNA文库结合高通量筛选技术在药物研发、基因功能研究、分子诊断、...
规划高效的CRISPR筛选始于针对感兴趣的基因或位点的sgRNA文库的设计。然后合成与sgRNA设计相对应的寡核苷酸池,并将其克隆到载体中以表达sgRNA,或转录成RNA以在将进行筛选的细胞系统中转染。 合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提,sgRNA文库结合高通量筛选技术在药物研发、基因功能研究、分子诊断、...
(1)测序方案 (2)测序项目 如有需求请咨询: sgRNA文库构建:RNAservice@tsingke.com.cn. CRISPR Screen(sgRNA文库)测序分析服务:bj-btseq@tsingke.com.cn. 编辑于 2023-10-18 14:43・天津 基因调控 赞同3添加评论 分享喜欢收藏申请转载 ...
进行CRISPR文库筛选的步骤:1)选择sgRNA文库;目前市面上提供全基因组文库和靶向多种信号通路的亚文库可以满足大部分科研人的需求,当然也可以根据自己的实验需求定制文库(如通过RNA-Seq筛选出的DEGs,KEGG、GO、GSEA分析等找出候选基因群,Ubigene靶点筛选可覆盖肿瘤、病毒感染、信号通路、代谢和免疫等方向)。2)制定筛选方案...
规划高效的CRISPR筛选始于针对感兴趣的基因或位点的sgRNA文库的设计。然后合成与sgRNA设计相对应的寡核苷酸池,并将其克隆到载体中以表达sgRNA,或转录成RNA以在将进行筛选的细胞系统中转染。 合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提,sgRNA文库结合高通量筛选技术在药物研发、基因功能研究、分子诊断、...
缺乏设计引导RNA(sgRNA)的有效生物信息学工具,是CRISPR/Cas9应用面临的一大问题。为了解决这一迫切的需要,华盛顿大学的王小伟(Xiaowei Wang)博士领导研究团队揭示了功能性引导RNA的特点,为人们提供了设计引导RNA的新工具。他们对CRISPR RNA-seq数据进行分析,鉴定了许多代表高效sgRNA的新特征。研究人员此基础上开发的生物信...
整合分析在单细胞RNA测序(scRNA-seq)工作中扮演着关键角色,特别是在处理复杂细胞类型时,如跨实验批次、供体或条件的数据集整合。这一过程有助于识别并匹配共享的细胞类型和状态,从而增强统计能力并促进跨数据集的准确比较。Seurat软件在整合分析中扮演着重要角色,特别是在早期版本中引入了基于锚点的方...