近日,《生物技术通报》在线发表了《基于BSA-seq和RNA-seq挖掘水稻株高相关QTL》文章。本研究使用籼稻油占8号和广西普通野生稻构建的CSSL群体以及现代分子生物学技术,对广西普通野生稻进行研究,通过二代测序和混池分析方法,鉴定广西普通野生稻基因组...
近日,中科院宁波材料所慈溪医工所郑建萍研究员团队借助新格元单细胞测序技术揭示了UVB辐射诱导皮肤光老化相关炎症及维生素D的保护作用。该研究成果即将发表在《gene》期刊上,题为“Single-cell RNA-seq of UVB-radiated Skin Reveals Landscape...
本研究通过RRBS+RNA-seq的综合分析揭示了在NOD小鼠SS相关干眼症的发展过程中,泪腺的基因组DNA甲基化水平增加。NOD小鼠泪腺中上调的Itgal、Icosl、Vav1和Irf4基因与T细胞介导的免疫反应密切相关,可能在SS相关干眼症的发病机制中发挥重要作用。此外,Itgal和Irf4启动子区域的DNA甲基化水平降低,可能是SS相关干眼症中Itgal和Ir...
单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在细菌检测中的应用较为有限,尤其在检测大规模的细菌群体以及描述细菌群体内的异质性时存在一定局限性,探索新的细菌单细胞测序方法对于研究微生物系统至关重要。近日,美国麻省理工学院-哈佛大学的博德研究所的研究者们在《Cell》期刊发表了一项研究,报道了一种高度可扩展的细菌单细胞RNA-...
本期分享一篇整合单细胞和bulk-RNA seq数据分析的文章,揭示了抗原呈递和过程中的肿瘤相关成纤维细胞,并建立了前列腺癌的预测特征模型。文章于2024年1月发表于《Journal of Translational Medicine》,通讯作者为上海交通大学的韩邦旻教授,标题“Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data unveils antigen presenta...
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近日,中科院宁波材料所慈溪医工所郑建萍研究员团队借助新格元单细胞测序技术揭示了UVB辐射诱导皮肤光老化相关炎症及维生素D的保护作用。该研究成果即将发表在《gene》期刊上,题为“Single-cell RNA-seq of UVB-radiated Skin Reveals Landscape of Photoaging-related Inflammation and Protection by Vitamin D”。
近日,《生物技术通报》在线发表了《基于BSA-seq和RNA-seq挖掘水稻株高相关QTL》文章。本研究使用籼稻油占8号和广西普通野生稻构建的CSSL群体以及现代分子生物学技术,对广西普通野生稻进行研究,通过二代测序和混池分析方法,鉴定广西普通野生稻基因组中与株高相关的QTL,进而筛选出在株高调控中可能起到关键作用的候选基...
易基因为本研究提供RRBS+RNA-seq技术服务。 研究结果: RRBS分析结果表明,随着SS相关干眼症的发展,NOD小鼠泪腺中的DNA甲基化水平增加,且主要在GTP酶激活和Ras信号通路中富集。RNA-Seq分析结果表明,与4周正常对照小鼠相比,8、12和16周龄的NOD小鼠分别有1321、2549和3712个DEGs;GO分析揭示DEGs主要富集在T细胞免疫反应中...
易基因为本研究提供RRBS+RNA-seq技术服务。 研究结果: RRBS分析结果表明,随着SS相关干眼症的发展,NOD小鼠泪腺中的DNA甲基化水平增加,且主要在GTP酶激活和Ras信号通路中富集。RNA-Seq分析结果表明,与4周正常对照小鼠相比,8、12和16周龄的NOD小鼠分别有1321、2549和3712个DEGs;GO分析揭示DEGs主要富集在T细胞免疫反应中...