本文揭示了二茂铁铱(III)二磷酸络合物Ir1在二茂铁基团的作用下可催化类芬顿反应生成•OH和LPO,从而诱导肿瘤细胞发生铁死亡的分子机制。RNA-seq结果和小鼠体内实验表明,Ir1可以显著影响与铁死亡和肿瘤免疫相关的通路,启动强烈的免疫反应,从而诱导免疫原性细胞死亡,有效抑制原发和远处肿瘤生长。 参考文献 Wen-Jin Wang, ...
2. 三个PULs可能参与了A23–1的降解 对在含有A23-1或葡萄糖的MM培养基上生长的BT进行了RNA-seq。结果显示,大多数基因与碳水化合物代谢相关。进一步分析发现,总共有394个基因在BT生长于A23-1时表现出表达变化。在394个上调基因中,有19个与BT在葡萄糖上生长相比表现出大量增加。这19个上调基因被分为3个离散的PU...
RNA-seq结果和小鼠体内实验表明,Ir1可以显著影响与铁死亡和肿瘤免疫相关的通路,启动强烈的免疫反应,从而诱导免疫原性细胞死亡,有效抑制原发和远处肿瘤生长。 参考文献 Wen-Jin Wang, Yu-Yi Ling, et al. Ferroptosis-Enhanced Cancer Immunity by a Ferrocene-Appended Iridium(III) Diphosphine Complex. Angewandte ...
3、RNA-seq分析PEG/Se@OMV-CD47nb治疗后瘤内巨噬细胞表达模式变化 利用FACS分选出PBS、PGE/Se@OMV-CD47nb+RA和anti-CD47处理的皮下成瘤小鼠的瘤内巨噬细胞,进行RNA-seq。分析结果显示,与PBS组相比,PGE/Se@OMV-CD47nb+RA组M1型巨噬细胞maker...
早期的RNA-seq实验从细胞群(如来源于某个组织或器官的细胞)中得到DGE数据,并可以应用于很多物种,如玉米(Zea mays),拟南芥(Arabiodopsis thaliana),酿酒酵母(Saccharomyces cerevisae),鼠(Mus musculus)和人(Homo sapiens)。虽然RNA-seq这个词通常包含很多不同的RNA相关的方法或生物应用,但DGE分析始终是它的主要应用...
RNAseq，即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术，作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用，在过去的十几年内迅速发展。而今，RNAseq在转录本变异检测，基因融合检测，可变剪切检测等场景均有大规模的应用。转录本变异检测，是指通过比较样本RNA序列和参考基因组对应序列，来寻找单碱基多态性和小片段的插入缺失...
通过RNAseq可以筛选出差异表达的分子,进而选取分子进行验证,构建调控机制。但可能整个实验的周期很长,比如1-2年时间,甚至更长。通过接触很多的客户,发现许多老师,在我们这里做了RNAseq实验,希望先对RNAseq的数据进行分析,整理,希望纯数据分析或者稍加验证就可以发表文章,虽然这类文章看过很多,但没有总结明确的规律,...
2020年2月10日发表于Nature Medicine杂志的文章应用强大的单细胞RNA-seq技术揭示了CD8+ T细胞可以作为转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗药物持续应答的血液标志物。 免疫检查点阻滞剂(immune checkpoint blockades,ICBs)在黑色素瘤治疗上取得了重大进展,已应用于临床的ICBs包括抗CTLA-4 单抗、抗PD-1及其配体PD...
这篇文章题目是“利用RNA-seq分析大豆近等基因系抗病株系和感病株系的基因表达模式差异”。 第一部分:背景 1、什么是近等基因系 近等基因系,就是一系列遗传背景几乎完全相同,只有一段染色体不同的材料。这类材料一般通过不断地回交和自交来获得。理论上,这类材料的性状差异,只由于一条基因片段的差异导致(上图...
RNAseq,即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术,作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今,RNAseq在转录本变异检测,基因融合检测,可变剪切检测等场景均有大规模的应用。转录本变异检测,是指通过比较样本RNA序列和参考基因组对应序列,来寻找单碱基多态性和小片段的插入缺失,其结...