RNA测序(RNA-seq)即转录组测序技术,就是把mRNA、小RNA和非编码RNA等或者其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来。反映出它们的表达水平。RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究,具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点。除了分析...
《RNA-seq 数据分析实用方法》是科学出版社出版的图书，作者是[芬]E.科佩莱恩，[芬]J.图梅拉，[芬]P.萨默沃，[瑞典]M.赫斯，[芬]G.旺 内容简介 本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法，内容涵盖数据分析的整个工作流程，包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的...
《RNA-Seq策略探索福氏志贺氏菌体内外表达谱差异》是依托中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，由王恒樑担任项目负责人的面上项目。中文摘要 痢疾是由志贺氏菌引起的严重肠道传染病，在今后相当长时间内仍将是传染病防治工作中的重点。本项目计划拟通过以Solexa测序方法为基础的转录表达谱研究（RNA-Seq），获得...
《用RNA-Seq新技术筛选和鉴定与荔枝落果相关的基因》是依托华南农业大学，由李建国担任项目负责人的面上项目。项目摘要 该项目以华南特色果树荔枝为对象，落果是其生产中亟待解决的一个瓶颈问题，果实脱落与调控的分子机理也是当今果实发育领域研究的一个热点问题。该项目在科学严谨的田间试验设计（植物生长调节剂延迟和...
根据对标准物质RNA-seq数据分析和噪声消除的研究结果，提出一套从实验设计到数据分析的有效控制噪声指南，撰写RNA-seq实验与数据分析白皮书，从实验设计、样品收集、数据产生、处理和解读等全流程规范化操作的技术标准初稿，并在此基础上建立参比数据，为新的高通量技术和算法开发提供数据参考，为保证转录组实验和分析的可...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学，由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平（GEL）的测量，GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用，但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
今天咱们来聊聊RNA-Seq前处理的小技巧,帮你让实验结果更上一层楼!面对总RNA中占比高达80-98%的rRNA,我们该如何选择?是mRNA富集还是rRNA去除?这直接关系到你的测序资源分配和成本控制。 Poly(A)富集:简单又高效 🌟 首先,咱们来说说Poly(A)富集。这个方法主要是利用磁珠上的Oligo dT来富集带有Poly A尾的mRNA...
《基于高通量RNA-seq数据转录组拼接的关键技术与算法研究》是依托山东大学，由李国君担任项目负责人的重点项目。中文摘要 研究表明癌症等复杂疾病与转录过程中的可变剪接密切相关，因此认知转录产物的种类、特异性及表达量对于癌症机理研究及临床诊断具有重要意义。高通量的RNA-seq测序技术为揭示和研究真核生物转录组...
《仅基于RNA-Seq数据拼装可变剪接转录组的计算方法研究》是依托山东大学，由李国君担任项目负责人的面上项目。中文摘要 可变剪接是指从一个前体mRNA中通过不同的剪接方式产生不同的成熟mRNA的过程。可变剪接是调控基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。在人类基因组中，大约95% 的多外显子基因中存在可变剪接。基...