最早的RNA-seq，把一大群细胞混在一起，抽出RNA一起测序。由于所使用的管子枪头等器材容易粘附RNA，实...
1.技术优化和创新:随着单细胞测序技术的不断发展,研究人员正在努力提高其通量、灵敏度和准确性。例如,北京大学汤富酬教授与文路副研究员开发的基于第三代测序平台的单细胞RNA-seq技术,通过提高数据处理的高通量和高灵敏度,为全长转录本的检测提供了新的工具。 2.多组学数据整合:单细胞多组学测序技术正迅速发展,结合...
RNA-seq的测序误差主要由生物学误差和技术性误差造成。为了得到无偏的数据，应进行生物学重复，以确保结论的可复现性。测序质量可能出现问题，常见原因是仪器对碱基染色误判，导致机器误判。碱基质量差的原因可能包括某些核苷酸对颜色附着不明显，或大片区域颜色相同，而其中仅有几个不同颜色的点。单细胞RNA-...
在过去的十几年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在转录组层面分析差异基因表达(DEG)和mRNA差异剪接的必备工具。时代和技术的进步下,RNA-seq也在进一步发展,基于更新的技术,RNA-seq可以在单细胞、翻译、空间等方向都有进一步的应用。与长读长技术的结合创新更是有助于更全面地了解RNA和转录乃至调控过程。
在过去的十年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在全转录组范围内分析差异基因表达和mRNAs差异剪接的重要工具。然而,随着下一代测序技术的发展,RNA-seq技术也在不断发展。现在,RNA-seq用于研究RNA生物学的许多方面,其中包括单细胞基因表达、翻译(翻译组,translatome)和RNA结构(结构组,structurome)。RNA-seq的其它应用也在...
相比之下,RNA-Seq具有很多优势。它能以单碱基分辨率测定特定基因的表达水平,了解等位基因特异性表达、选择性剪接、RNA编辑等等。RNA-Seq读取转录组序列的能力也让以前未研究过的新事件或新物种得以鉴定,而无需背景知识。 聚焦单个细胞 细胞分离技术的进步让RNA-Seq开始应用在单个细胞上,而不再是一大块样本 。NEB的开...
RNA-seq,即通过高通量测序技术进行的转录组测序分析技术。最初作为研究mRNA,small RNA,non-coding RNA 等表达水平、表达差异基因的应用,在过去的十几年内迅速发展。而今, RNA-seq 在转录本变异、基因融合、可变剪切检测等场景均有大规模的应用。靶向 RNA-seq 则是对特定的转录本进行重点分析,与标准RNA-seq 类似...
在过去的十几年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在转录组层面分析差异基因表达(DEG)和mRNA差异剪接的必备工具。时代和技术的进步下,RNA-seq也在进一步发展,基于更新的技术,RNA-seq可以在单细胞、翻译、空间等方向都有进一步的应用。与长读长技术的结合创新更是有助于更全面地了解RNA和转录乃至调控过程。
其中,随着转录组学的流行,miRNA、lncRNA和circRNA等非编码RNA的爆红,转录组测序技术(RNA-seq)的发展速度也一路水涨船高、势如破竹。 而技术的进步和成本降低也使得RNA-seq这种高大上的技术,已经逐渐走下“神坛”、站在了潮流的最前线了。 一般而言,如果要做二代测序,不分析点剪接异构、功能调控、新转录本发现...